论文： 《疑心生暗鬼：赵秉钧如何被“误”为宋案主谋》，《近代史研究》2016年第2期。《“宋案”中之袁世凯——何曾主谋刺宋》，《史学月刊》2016年第2期。《洪述祖——“刺宋案”唯一主谋》，《史学集刊》2016年第1期。《洪述祖甲午“丑史”辩诬》，《史林》2015年第5期。《“宋案“嫌犯应夔丞的绝妙“供述”——“监督议院政府神圣裁判机关简明宣告文”解读》，《民国档案》2015年第4期。《陈其美主谋杀宋谬说之流传》，《历史教学》（高校版）2015年第9期。《青柳笃恒：一个被湮没的袁世凯的高等间谍》，《近代史研究》2014年第6期。《攻击与回应：民初袁世凯三传面世之幕后故事》，《历史教学》（高校版）2014年第4期。《民元北大校长严复去职内幕》，《北京大学教育评论》2013年第2期。 《有贺长雄与民初制宪活动几件史事辨析》，《近代史研究》2013年第1期。 《论袁世凯策划民元“北京兵变”说之不能成立》，《史学集刊》2013年第1期。 《民国大学的日本史教育》，收入徐勇、王晓秋主编《中日文化交流两千年：回顾与展望》，社会科学文献出版社2013年。 《民国大学的亚洲史教育》，《北大史学》第17辑，北京大学出版社2012年。 《由“分期”史到“断代”史——民国时期大学“中国通史”讲授体系之演变》，《史学集刊》2011年第1期。 《近代中国大学史学教授群像》，《近代史研究》2011年第1期。 《近代中国大学史学科系设置考察》，《史学月刊》2011年第8期。 《留日学生与清末新式学堂教育》，《文史知识》2011年第11期。 A New Trend in the“National Studies Fever”of the Post-May Fourth Era:The Establishment of National Studies Department in Universities and Its Outcomes, Chinese Studies in History,Vol.43,No.4,Summer 2010.《民国时期大学哲学科系的“热”与“冷”》，《北京大学教育评论》2010年第3期。 《五四以后“国学”热的一个新动向：大学“国学系”的设立及其结局》，收入《五四的历史与历史中的五四》，北京大学出版社2010年。 《五四后至抗战前北大史学系的课程变革》，《北大讲座》第17辑，北京大学出版社2008年。 《“两种清末宪法草案稿本”质疑》，《历史研究》（北京）第2期，2007年。 《抗战前北大史学系的课程变革》，《近代史研究》（北京）第1期，2006年。 《孟森北大授课讲义三种编撰考》，《史学史研究》（北京），第4期，2006年。 《辛亥革命史上不容忽视的插曲——1905年留东学生迎孙盛会的历史内涵》，《学术研究》 第2期，2006年。 《中研院史语所与北大史学系的学术关系》，《史学月刊》第7期，2006年。 《胡虔生平系年》，《中国典籍与文化》第4期，2005年。（同上） 《论浮田和民<史学通论>与梁启超新史学思想的关系》，《史学月刊》2003年第5期。 《门户之争，还是汉宋兼采？——析方东树<汉学商兑>之立意》，《思想战线》2001年第1期。 《盛氏<皇朝经世文续编>纂辑考》，《社会科学辑刊》2000年第2期。 《戊戌时期的端方》，《戊戌维新与近代中国的改革》（戊戌维新一百周年国际学术讨论会论文集）社会科学文献出版社2000年。 《论清代游幕学人的撰著活动及其影响》，《北京大学学报》1999年第5期。 《浅论李鸿章幕府——兼与曾国藩幕府比较》，《安徽史学》1999年第2期。 《徐乾学幕府研究》，《史学月刊》1998年第3期。 《阮元幕府及其对清代学术的贡献》，《学术论丛》1998年第2期。 《清末资政院议政活动一瞥——留日出身议员对议场的控制》，《北京社会科学》1998年第2期。 《留日学生与清末教育改革》，《日本学》1996年第7辑。◎主编《戊戌维新与清末新政》（与王晓秋教授主编），北京大学出版社1998年。 《丁则良文集》（与丁则勤教授编），清华大学出版社2009年。 《史学大家的风范》（“西南联大名师”丛书之一，与杨琥主编），云南教育出版社2012年。
