申欣
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资料介绍
个人简历
申欣,男,1981年8月出生,博士毕业于中国科学院海洋研究所,教授。入选“香江学者”计划(“海洋科学”学科全国首位入选者)、江苏省“333高层次人才工程”、江苏省“青蓝工程”中青年学术带头人、江苏省“六大人才高峰”等省级及以上人才计划。作为“无脊椎动物系统发育线粒体基因组研究”项目第一完成人,获得江苏省高校自然科学成果奖。在《BMCGenomics》《MolecularPhylogeneticsandEvolution》《ZoologicaScripta》《MarineandFreshwaterResearch》《ScienceChina》《ComparativeBiochemistryandPhysiologyPartD》《MolecularBiologyandEvolution》《Gene》《JournalofBiogeography》《MolecularBiologyReports》《MarineGenomics》《Genome》《MarineDrugs》《JournalofMolecularEvolution》《MitochondrialDNAPartA》《JournalofEnvironmentalSciences》《ActaOceanologicaSinica》《GenomeBiologyandEvolution》《中国科学》《海洋学报》和《海洋与湖沼》等期刊上发表论文100余篇,其中SCI论文40余篇,被国内外同行学者引用近1000次。一、教学情况承担《生物信息学》(研究生)、《文献检索与科技论文写作》(研究生)和《生物信息学》(本科生)等多门专业课程的教学工作。主持“江苏省高校研究生培养创新工程建设专项重点项目”等教研课题3项。二、科研情况(二)承担科研项目主持“国家自然科学基金”、“香江学者”人才基金、海洋科学与技术国家实验室鳌山科技创新计划子项目和江苏省高校自然科学基金重大项目(A类)等科研课题十几项。参与申请并获得资助“国家自然科学基金”项目8项及“国家科技部‘863’项目”1项。作为科研骨干,参与完成“国家重点基础研究发展规划(973)项目”、“中国科学院知识创新重要方向项目”、“中国科学院‘百人计划’项目”、“国家高技术研究发展规划(863)项目”和“国家自然科学基金(重大研究计划)”等科研课题近二十项。部分如下:1.基于线粒体基因组全序列的唇口目苔藓动物系统发育研究(40906067),国家自然科学基金,2010-20132.亚洲海水/淡水生物亲缘地理学(XJ2012056),“香江学者”人才基金,2013-20153.非模式生物基因组遗传变异的识别算法和进化基因组计算平台的建立(91131013),国家自然科学基金(重大研究计划),2013-20164.中国西施舌亚种的线粒体基因组证据(BK20131210),江苏省自然科学基金,2014-20165.水母发生过程、源头和成灾机理(2016ASKJ02-02),海洋科学与技术国家实验室鳌山科技创新计划项目,2016-20176.基于分子证据和形态结构的无柄目系统重建研究(15KJA170001),江苏省教育厅自然科学基金重大项目(A类),2015-2018三、成果获奖及人才计划1.江苏省“青蓝工程”优秀青年骨干教师,20102.江苏省“优秀毕业设计(论文)指导教师奖”,20113.“香江学者”奖(“海洋科学”学科全国首位获得者),20124.辽宁省“水产学会优秀论文”一等奖(通讯作者),20125.江苏省“333高层次人才培养工程”中青年科学技术带头人,20136.连云港市“521高层次人才培养工程”学术技术带头人(第2层次),20147.江苏省“六大人才高峰”,20168.江苏省高校自然科学成果奖(第一完成人),20169.江苏省“青蓝工程”中青年学术带头人,201610.连云港市“521高层次人才培养工程”学术技术带头人(第1层次),2017研究领域
海洋动物分子系统学、基因组学和生物地理学。近期论文
[1]ShenX.(申欣),MaX.,RenJ.,ZhaoF.:AclosephylogeneticrelationshipbetweenSipunculaandAnnelidaevidencedfromthecompletemitochondrialgenomesequenceofPhascolosomaesculenta.BMCGenomics,2009,10:136-146.(SCI)[2]ShenX.(申欣),RenJ.,CuiZ.,ShaZ.,WangB.,XiangJ.,LiuB.:Thecompletemitochondrialgenomesoftwocommonshrimps(LitopenaeusvannameiandFenneropenaeuschinensis)andtheirphylogenomicconsiderations.Gene,2007,403(1-2):98-109.(SCI)[3]ShenX.(申欣),TianM.,LiuZ.,ChengH.,TanJ.,MengX.,RenJ.:CompletemitochondrialgenomeoftheseacucumberApostichopusjaponicus(Echinodermata:Holothuroidea):thefirstrepresentativefromthesubclassAspidochirotaceawiththeechinodermgroundpattern.Gene,2009,439(1-2):79-86.(SCI)[4]ShenX.(申欣),SunM.,WuZ.,TianM.,ChengH.,ZhaoF.,MengX.:ThecompletemitochondrialgenomeoftheridgetailwhiteprawnExopalaemoncarinicaudaHolthuis,1950(Crustacean:Decapoda:Palaemonidae)revealedanovelrearrangementoftRNAgenes.Gene,2009,437(1-2):1-8.(SCI)[5]ShenX.(申欣),WangH.,RenJ.,TianM.,WangM.:ThemitochondrialgenomeofEuphausiasuperba(PrydzBay)(Crustacea:Malacostraca:Euphausiacea)revealsanovelgenearrangementandpotentialmolecularmarkers.MolecularBiologyReports,2010,37(2):771-784.(SCI)[6]ShenX.(申欣),WuZ.,SunM.,RenJ.,LiuB.:ThecompletemitochondrialgenomesequenceofWhitmaniapigra(Annelida,Hirudinea):thefirstrepresentativefromtheclassHirudinea.ComparativeBiochemistryandPhysiologyPartD,2011,6(2):133-138.(SCI)[7]ShenX.(申欣),WangH.,WangM.,LiuB.:ThecompletemitochondrialgenomesequenceofEuphausiapacifica(Malacostraca:Euphausiacea)revealsanovelgeneorderandunusualtandemrepeats.Genome,2011,54(11):911-922.(SCI)[8]ShenX.(申欣),TianM.,MengX.,LiuH.,ChengH.,ZhuC.,ZhaoF.:CompletemitochondrialgenomeofMembraniporagrandicella(Bryozoa:Cheilostomatida)determinedwithnext-generationsequencing:thefirstrepresentativeofthesuborderMalacostegina.ComparativeBiochemistryandPhysiologyPartD,2012,7(3):248-253.(SCI)[9]ShenX.(申欣),LiX.,ShaZ.,YanB.,XuQ.:CompletemitochondrialgenomeoftheJapanesesnappingshrimpAlpheusjaponicus(Crustacea:Decapoda:Caridea):generearrangementandphylogenywithinCaridea.ScienceChinaLifeSciences,2012,55(7):591-598.(SCI)[10]ShenX.(申欣),MengX.,ChuK.,ZhanN.,TianM.,LiangM.,HaoJ.:Comparativemitogenomicanalysisrevealscrypticspecies:AcasestudyinMactridae(Mollusca:Bivalvia).ComparativeBiochemistryandPhysiologyPartD,2014,12:1-9.(SCI)[11]ShenX.(申欣),SunM.,TianM.,ZhaoF.,ChuK.:ThefirstmitochondrialgenomefromMysida(Crustacea:Malacostraca)revealsanunusualgenearrangement.MitochondrialDNA,2015,26(2):252-254.(SCI)[12]ShenX.(申欣),TianM.,YanB.,ChuK.:PhylomitogenomicsofMalacostraca(Arthropoda:Crustacea).ActaOceanologicaSinica,2015,34(2):1-9.(SCI)[13]ShenX.(申欣),ChanB.,TsangL.:ThecompletemitochondrialgenomeofcommonfoulingbarnacleAmphibalanusamphitrite(Darwin,1854)(Sessilia:Balanidae)revealsgenerearrangementscomparedtopancrustaceangroundpattern.MitochondrialDNA,2015,26(5):773-774.(SCI)[14]ShenX.(申欣),TsangL.,ChuK.,AchituvY.,ChanB.*:MitochondrialgenomeoftheintertidalacornbarnacleTetraclitaserrataDarwin,1854(Crustacea:Sessilia):GeneordercomparisonandphylogeneticconsiderationwithinSessilia.MarineGenomics,2015,22:63-69.(SCI)[15]ShenX.(申欣),TianM.,ChuK.,WangJ.,ChenS.,LiuH.,ZhaoX.,ZhaoF.:ComparativemitogenomicanalysesrevealcrypticdiversityofthebryozoanBugulaneritinaLinnaeus,1758,intheYellowSea.MarineandFreshwaterResearch,2016,67(8):1241-1252.(SCI)[16]SunM.,WuZ.,ShenX.(申欣)*,RenJ.,LiuX.,LiuH.,LiuB.:ThecompletemitochondrialgenomeofWatersiporasubtorquata(Bryozoa,Gymnolaemata,Ctenostomata)withphylogeneticconsiderationofBryozoa.Gene,2009,439(1-2):17-24.(*通讯作者,SCI)[17]WuZ.†,ShenX.(申欣)†,SunM.,RenJ.,WangY.,HuangY.,LiuB.:PhylogeneticanalysesofcompletemitochondrialgenomeofUrechisunicinctus(Echiura)supportthatechiuransarederivedannelids.MolecularPhylogeneticsandEvolution,2009,52(2):558-562.(†并列第一作者,SCI)[18]SunM.,ShenX.(申欣)*,LiuH.,LiuX.,WuZ.,LiuB.:CompletemitochondrialgenomeofTubuliporaflabellaris(Bryozoa:Stenolaemata):thefirstrepresentativefromtheclassStenolaematawithuniquegeneorder.MarineGenomics,2011,4(3):159-165.(*通讯作者,SCI)[19]RenJ.,ShenX.(申欣),SunM.,JiangF.,YuY.,ChiZ.,LiuB.:ThecompletemitochondrialgenomeoftheclamMeretrixpetechialis(Mollusca:Bivalvia:Veneridae).MitochondrialDNA,2009,20(4):78-87.(SCI)[20]RenJ.,ShenX.(申欣),JiangF.,LiuB.:Themitochondrialgenomesoftwoscallops,ArgopectenirradiansandChlamysfarreri(Mollusca:Bivalvia):themosthighlyrearrangedgeneorderinthefamilyPectinidae.JournalofMolecularEvolution,2010,70(1):57-68.(SCI)[21]MengX.,ZhaoN.,ShenX.(申欣)*,HaoJ.,LiangM.,ZhuX.,ChengH.,YanB.,LiuZ.:CompletemitochondrialgenomeofCoelomactraantiquata(Mollusca:Bivalvia):ThefirstrepresentativefromthefamilyMactridaewithnovelgeneorderandunusualtandemrepeats.ComparativeBiochemistryandPhysiologyPartD,2012,7(2):175-179.(*通讯作者,SCI)[22]MengX.,ShenX.(申欣)*,ZhaoN.,TianM.,LiangM.,HaoJ.,ChengH.,YanB.,DongZ.,ZhuX.:MitogenomicsrevealstwosubspeciesinCoelomactraantiquata(Mollusca:Bivalvia).MitochondrialDNA,2012,24(2):102-104.(*通讯作者,SCI)[23]MengX.,ShenX.(申欣)*,ZhaoN.,TianM.,LiangM.,HaoJ.,ChengH.,YanB.,DongZ.,ZhuX.:ThecompletemitochondrialgenomeoftheclamMactraveneriformis(Bivalvia:Mactridae):Hasauniquenon-codingregion,missingatp8andtypicaltRNASer.MitochondrialDNA,2013,24(6):613-615.(*通讯作者,SCI)[24]ChengH.,MengX.,SunS.,ShiX.,PengY.,DongZ.,ShenX.(申欣):CloningandexpressionanalysisofacDNAencodinglipoproteinlipasefromliverofadultgrasscarp(Ctenopharyngodonidella).AquacultureResearch,2009,40(16):1838-1848.(SCI)[25]ChengH.,SunS.,PengY.,ShiX.,ShenX.(申欣),MengX.,DongZ.:cDNAsequenceandtissuesexpressionanalysisoflipoproteinlipasefromcommoncarp(CyprinuscarpioVar.Jian).MolecularBiologyReports,2010,37(6):2665-2673.(SCI)[26]ChengH.,JiN.,PengY.,ShenX.(申欣),XuJ.,DongZ.:Molecularcharacterizationandtissue-specificexpressionoftheacetyl-CoAcarboxylasealphagenefromGrasscarp,Ctenopharyngodonidella.Gene,2011,487(1):46-51.(SCI)[27]TsangL.†,ShenX.(申欣)†,ChuK.,ChanB.:CompletemitochondrialgenomeoftheacornbarnacleStriatobalanusamaryllis(Crustacea:Maxillopoda):ThefirstrepresentativefromArchaeobalanidae.MitochondrialDNA,2015,26(5):761-762.(†并列第一作者,SCI)[28]Wang,M.,SunS.,LiC.,ShenX.(申欣):DistinctivemitochondrialgenomeofCalanoidcopepodCalanussinicuswithmultiplelargenon-codingregionsandreshuffledgeneorder:usefulmolecularmarkersforphylogeneticandpopulationstudies.BMCGenomics,2011,12:73-92.(SCI)[29]WangZ.†,ShenX.(申欣)†,LiuB.,SuJ.,YonezawaT.,YuY.,GuoS.,HoS.Y.W.,VilàC.,HasegawaM.,LiuJ.:PhylogeographicalanalysesofdomesticandwildyaksbasedonmitochondrialDNA:newdataandreappraisal.JournalofBiogeography,2010,37(12):2332-2344.(†并列第一作者,SCI)[30]WangZ.,YonezawaT.,LiuB.,MaT.,ShenX.(申欣),SuJ.,GuoS.,HasegawaM.andLiuJ.:Domesticationrelaxedselectiveconstraintsontheyakmitochondrialgenome.MolecularBiologyandEvolution2011,28(5):1553-1556.(SCI)[31]KennyN.,SinY.,ShenX.(申欣),ZheQ.,WangW.,ChanT.,TobeS.,ShimeldS.,ChuK.,HuiJ.:Genomicsequenceandexperimentaltractabilityofanewdecapodshrimpmodel,Neocaridinadenticulata.MarineDrugs,2014,12(3):1419-1437.(SCI)[32]KennyN.,ShenX.(申欣),ChanK.,WongW.,ChanT.,ChuK.,Lam,H.,HuiJ.*:Draftgenomeoftherustymillipede,Trigoniuluscorallinus,illuminatesDiplopod,MyriapodandArthropodevolution.GenomeBiologyandEvolution,2015,7(5):1280-1295.(SCI)[33]申欣,孙松,张光涛.浮游生物光学计数器(OPC-1L)精度控制关键问题研究.海洋与湖沼,2008,39(4):341-347.[34]申欣,孙松,王海青,王敏晓,任建峰,张光涛,刘斌.南极磷虾(Euphausiasuperba)线粒体基因组特征及其分子标记应用.海洋与湖沼,2008,39(5):446-454.[35]申欣.对虾科线粒体基因组特征及基因差异位点分析.水产科学,2010,29(12):711-717.[36]申欣,吴志刚.单环刺螠线粒体基因组全序列的获得——长PCR结合鸟枪法测序.海洋科学,2010,34(12):26-29.[37]申欣,孙名安.长臂虾科线粒体基因组特征分析及分子标记探讨.水产科学,2011,30(6):347-351.[38]申欣,田美,孟学平,程汉良.10种软骨鱼线粒体基因组特征分析.渔业科学进展,2011,32(3):26-32.[39]申欣,田美,程汉良,孟学平,任建峰.海参纲线粒体基因组特征分析及分子标记探讨.水产科学,2011,30(7):400-404.[40]申欣,田美,孟学平,程汉良.文昌鱼线粒体基因组特征分析及分子标记探讨.海洋科学,2011,35(7):7-13.[41]申欣,王海青,王敏晓,刘斌.磷虾类线粒体基因组的特征和基因排列比较.渔业科学进展,2012,33(2):49-55.[42]申欣,田美,孟学平,程汉良,彭永兴,李士虎.鲟类线粒体基因组分子标记、遗传距离及系统演化分析.水产科学,2012,31(7):413-418.[43]申欣.星虫动物线粒体基因组全序列的基因排列和特征比较.水产科学,2012,31(9):554-559.[44]申欣,李晓,徐启华.日本鼓虾与鲜明鼓虾线粒体基因组全序列的分析比较.海洋学报,2012,34(5):147-153.[45]申欣,田美,孟学平,程汉良,李士虎.尾索动物线粒体基因组特征比较及分子系统发育.海洋科学,2012,36(11):30-37.[46]申欣,田美,朱长保,刘会莲,赵方庆.应用新一代测序技术测定大室别藻苔虫线粒体基因组全序列.海洋学报,2012,34(2):136-142.[47]申欣,李晓,沙忠利,阎斌伦,徐启华.日本鼓虾线粒体基因组:真虾下目内部的基因重排与系统发育.中国科学,2012,42(7):595-602.[48]申欣,田美,孟学平,程汉良,阎斌伦.棘皮动物线粒体基因组的基因重排、分子标记及系统发生分析.海洋学报,2013,35(5):137-146.[49]申欣,田美,孟学平,程汉良,许建和,阎斌伦.鲆鲽类线粒体基因排列、特征比较及系统发生分析.水产科学,2013,32(10):590-596.[50]申欣,田美,孟学平,程汉良,阎斌伦.鳗鲡目鱼类线粒体蛋白质编码基因易位及系统演化关系分析.海洋学报,2014,36(4):73-81.[51]申欣,田美,孟学平,程汉良,阎斌伦.鳍足类线粒体基因的选择压力比较及进化关系探讨.海洋学报,2014,36(6):87-93.受邀担任《MolecularPhylogeneticsandEvolution》《BMCGenomics》《ComparativeBiochemistryandPhysiology》《Gene》《MolecularBiologyReports》和《MarineGenomics》等国际SCI期刊审稿专家,受邀担任国家核心期刊《水产科学》编委。 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