余孝其（1965年7月—），男，汉族，四川资中人，1991年6月加入中国共产党，1993年4月参加工作，四川大学有机化学专业毕业，教授，博士研究生。现任中共四川省委教育工委副书记，四川省教育厅党组书记、厅长。中国化学会化学生物学专业委员会委员，中国化学会超分子化学专业委员会委员，四川省化学化工学会副理事长。

他也是四川大学化学学院教授、博士生导师，主要从事生物荧光探针与生物成像、基因及药物递送材料、生物催化与仿生催化等方面的研究工作。入选中华人民共和国教育部2009年度“长江学者”特聘教授、新世纪百千万人才工程国家级人选。