个人简历

2002-2006 中山大学 生物科学 学士
2006-2011 中国科学院广州生物医药与健康研究院 生化与分子生物学 博士
2011-2013 中国科学院广州生物医药与健康研究院 副研究员
2013至今 中国科学院广州生物医药与健康研究院 研究员
2016-2017 美国哈佛大学医学院 波士顿儿童医院 访问教授
承担科研项目情况：
国家重大科学研究计划（973）青年项目，项目负责人。
国家优秀青年科学基金项目，项目负责人。
国家自然科学基金面上项目（2017年），项目负责人。
国家自然科学基金面上项目（2013年）项目负责人。
广东省自然科学基金杰出青年基金，项目负责人。
广东省重大专项计划，项目负责人。
广州市科技计划项目重点项目，项目负责人。
获奖及荣誉：
国家自然科学奖二等奖
国家“万人计划”青年拔尖人才；
“973”计划青年科学家首席；
国家自然科学基金优秀青年；
广东省特支计划领军人才；
广东省自然科学基金杰出青年；
广东省科学技术一等奖（2015）；
广州市科学技术一等奖（2015）；
中国科学院杰出成就奖（团队）；
南粤创新奖（2016）

研究领域

1）以体细胞重编程等模型研究细胞命运决定的分子调控机理；主要探讨表观遗传调控与信号转导、转录因子之间的联系。
2）以细胞命运转化模型中采集的表观遗传组和单细胞转录组等大数据，通过计算生物学挖掘重要生物学机理。
3）以诱导多能干细胞（iPSC）应用为中心的技术体系开发。"生命是如何产生的？如何变复杂的？意识的本质是什么？这是生物学的三大关键问题，我们试图通过细胞命运和表观遗传的研究，对第二个问题做出关键推进，并引导到第三个问题。
细胞是生命活动的基本单位，从进化角度看，细胞先经历了细胞内结构的特化和功能的扩展，之后才开始多细胞生物的进化，多细胞生物个体则包含多种具备独特功能的细胞。多细胞生物的个体发育是几乎不涉及基因序列改变的，那这些细胞如何被引导到特定的细胞状态呢？这个问题被称为细胞命运决定，涉及表观遗传学、信号转导等等一系列基本科学问题。生命活动之所以难以理解，在于影响一个现象（如细胞命运）的因素是多维度的，因此进一步了解现在研究的细胞命运决定各因素之间的相互联系，将能够对进化中多细胞生物其细胞组织功能的形成有更深入的了解，也将有机会创造了解这种多维度支配下的生物系统的崭新思维模式。
细胞命运决定一方面是干细胞应用技术所亟需的基本理论，另一方面更是从细胞生物学角度探讨多细胞生物生命活动的重要基础研究命题。我们在过去的研究中初步揭示细胞外环境可以经过调控组蛋白、DNA甲基化影响细胞命运决定，长远目标是通过这一系列研究，清晰地理解多细胞生物的功能组织过程并提出新的生物学研究思路，也希望将这种知识运用到人类健康事业上。"

近期论文

（*为通讯作者）
1. Guo, L#.; Lin, L#.; Wang, X#.; Gao, M.; Mai, Y.; Wu, F.; Kuang, J.; Liu, H.; ...;Pei, D*.;Chen,J*.. Resolving Cell Fate Decisions during Somatic Cell Reprogramming by Single-Cell RNA-Seq. Molecular Cell, 2019. (*共同通讯作者)
2. Li, D#.; Liu, J#.; Yang, X#.; Zhou, C.; Guo, J.; Wu, C.; Qin, Y.; Guo, L.; ...; Hutchins, AP*.;Chen,J*.; Pei, D*.. Chromatin Accessibility Dynamics During Reprogramming. Cell Stem Cell, 2017. (*共同通讯作者)
3.Zhou, Z.; Yang, X.; He, J.; Liu, J.; Wu, F.; Yu, S.; Liu, Y.; Lin, R.; ...; Pei, D*.; Chen, J*. Kdm2b regulates somatic reprogramming through variant PRC1 complex dependent function. Cell Reports, 2017. (*共同通讯作者)
4. Liu, J.; Han, Q.; Peng, T.; Peng, M.; Wei, B.; Li, D.; Wang, X.; Yu, S.; ...; Chen, J*.; Pei, D*.The oncogene c-Jun impedes somatic cell reprogramming. Nature Cell Biology, 2015. (*共同通讯作者)
5. Chen, J#., Liu, H#., Liu, J., Qi, J., Wei, B., Yang, J., Liang, H., Chen, Y., Wu, Y., Guo, L., et al. H3K9 methylation is a barrier during somatic cell reprogramming into iPSCs. Nature Genetics, 2013.（首次阐明H3K9甲基化是重编程的重要障碍，ESI高引论文）
6. Chen, J#., Guo, L#., Zhang, L#., Wu, H., Yang, J., Liu, H., Wang, X., Hu, X., Gu, T., Zhou, Z., et al. Vitamin C modulates Tet1 function during somatic cell reprogramming. Nature Genetics, 2013.（阐明Vc对Tet1的功能的转化作用，当期杂志配发评论）
7. Chen, J#., Liu, J#., Chen, Y., Yang, J., Chen, J., Liu, H., Zhao, X., Mo, K., Song, H., Guo, L., et al. Rational optimization of reprogramming culture conditions for the generation of induced pluripotent stem cells with ultra-high efficiency and fast kinetics, Cell Research, 2011.
8. Chen, J#., Liu, J#., Yang, J., Chen, Y., Chen, J., Ni, S., Song, H., Zeng, L., Ding, K., and Pei, D. BMPs functionally replace Klf4 and support efficient reprogramming of mouse fibroblasts by Oct4 alone. Cell Research, 2010.
9. Chen, J., Liu, J., Han, Q., Qin, D., Xu, J., Chen, Y., Yang, J., Song, H., Yang, D., Peng, M., et al. Towards an Optimized Culture Medium for the Generation of Mouse Induced Pluripotent Stem Cells. Journal of Biological Chemistry, 2010.
10.Wang, Y#., Chen, J#., Hu, J.-L., Wei, X.-X., Qin, D., Gao, J., Zhang, L., Jiang, J., Li, J.-S., Liu, J., et al. Reprogramming of mouse and human somatic cells by high-performance engineered factors. EMBO reports , 2011.
11.Chen, J., Han, Q., and Pei, D. EMT and MET as paradigms for cell fate switching. J Mol Cell Biol, 2012. (Review)
12.Chen, J., and Pei, D. Reprogramming in suspension. Nature Methods , 2012. (News and views)
13.Chen, Y#., Guo, L#., Chen, J#., Zhao, X., Zhou, W., Zhang, C., Wang, J., Jin, L., Pei, D., et al. Genome-wide CNV analysis in mouse induced pluripotent stem cells reveals dosage effect of pluripotent factors on genome integrity. BMC Genomics, 2014 .
14.Li, R., Liang, J., Ni, S., Zhou, T., Qing, X., Li, H., He, W., Chen, J., Li, F., et al. A Mesenchymal-to-Epithelial Transition Initiates and Is Required for the Nuclear Reprogramming of Mouse Fibroblasts. Cell Stem Cell, 2010.
15.Esteban, M.A., Wang, T., Qin, B., Yang, J., Qin, D., Cai, J., Li, W., Weng, Z., Chen, J., Ni, S., et al. Vitamin C enhances the generation of mouse and human induced pluripotent stem cells. Cell Stem Cell , 2009.
中国科学院再生生物学重点实验室 常务副主任
广东省干细胞与再生医学重点实验室 常务副主任