个人简历

中国科学院大学岗位教授。1996年西安交通大学自动化专业学士，1999年中国舰船研究院系统工程专业硕士，2004年中国科学院大学模式识别与智能系统专业博士。现工作于中国科学院自动化所模式识别国家重点实验室/类脑智能研究中心，任中科院自动化所微观重建与智能分析团队负责人、中科院人工智能创新研究院2035创新团队负责人、中科院北京生命科学大型仪器中心显微分析技术平台负责人、北京怀柔综合性国家科学中心脑智交叉平台总工程师。入选中国科学院关键技术人才、中国科学院脑科学与智能技术卓越中心骨干人才。发表学术论文60余篇，授权发明专利15项，软件著作权登记12项。
招生方向：显微影像智能分析，图像与视频处理
教育背景
2001-09--2004-08 中国科学院研究生院 博士
1996-09--1999-04 中国舰船研究院 硕士
1992-09--1996-07 西安交通大学 学士
学历
1992～1996年，西安交通大学电气工程学院自动化系，学士学位。
1996～1997年，中国科学技术大学自动化系，学习硕士学位课程。
1997～1999年，中国舰船研究院系统工程专业，硕士学位。
2001～2004年，中国科学院自动化所模式识别与智能系统专业，博士学位。
工作经历
2008.6~2015.8，国家专用集成电路设计工程技术中心研发部总工程师。
2015.1~ ，微观重建与智能分析团队负责人、显微分析技术平台负责人。
2018.1~ ，北京怀柔综合性国家科学中心脑认知功能图谱与类脑智能交叉研究平台总工程师。
2016-09~现在, 中国科学院大学, 岗位教授
2015-07~现在, 中国科学院脑科学与智能技术卓越创新中心, 年轻骨干
2014-10~现在, 中国科学院自动化所, 研究员
2007-06~2014-10,中国科学院自动化所, 高级工程师
2004-08~2007-06,中国科学院自动化所, 助理研究员
1999-04~2001-08,江苏自动化研究所, 工程师
教授课程
脑科学与新技术-神经网络结构追踪和重构技术
奖励信息
（1） 中国科学院关键技术人才, 院级, 2015
专利成果
（ 1 ） 一种基于MCA的图像超分辨率重建方法, 发明, 2015, 第 1 作者, 专利号: ZL 201110014847.1
（ 2 ） 一种基于图像边缘保持自适应分解的超分辨率重建方法, 发明, 2014, 第 2 作者, 专利号: ZL 201110014854.1
（ 3 ） 基于带限二维EVD与Gabor自适应滤波的图像时频分析法, 发明, 2014, 第 2 作者, 专利号: ZL 201110014849.0
（ 4 ） 利用自适应多尺度基本形式实现图像融合的方法, 发明, 2014, 第 3 作者, 专利号: ZL 201110014854.2
（ 5 ） 一种基于多尺度基本形式的相似尺度图像融合方法, 发明, 2014, 第 1 作者, 专利号: ZL 201110014846.7
（ 6 ） 小波邻域高斯模型图像复原方法, 发明, 2014, 第 2 作者, 专利号: ZL 201110014853.7
（ 7 ） 一种对扫描电子显微镜畸变进行校正的方法, 发明, 2015, 第 2 作者, 专利号: ZL 201110014855.6
（ 8 ） 显著化生物组织切片膜结构的刻蚀工艺及图像合成方法, 发明, 2018, 第 1 作者, 专利号: ZL 201510450536.8
（ 9 ） 基于双光子图像的突触检测方法, 发明, 2019, 第 2 作者, 专利号: ZL 201610716189.3
（ 10 ） 基于电镜序列切片图像的突触检测方法, 发明, 2017, 第 2 作者, 专利号: 201610802612.1
（ 11 ） 基于序列切片的显微镜图像采集方法, 发明, 2019, 第 3 作者, 专利号: ZL 201610978135.4
（ 12 ） 基于线粒体结构的图像配准方法及装置、存储介质及设备, 发明, 2017, 第 2 作者, 专利号: 201710610438.5
（ 13 ） 生物组织序列切片显微图像的配准方法及装置, 发明, 2017, 第 2 作者, 专利号: ZL 201710638426.3
（ 14 ） 低能量背散射电子探测器, 发明, 2017, 第 2 作者, 专利号: ZL 201710936186.5
（ 15 ） 面向序列切片的扫描电镜图像实时配准装置及方法, 发明, 2017, 第 2 作者, 专利号: ZL 201711248908.4
（ 16 ） 多幅显微图像拼接中的灰度矫正方法及装置, 发明, 2017, 第 3 作者, 专利号: ZL 201711287182.5
（ 17 ） 超薄切片机及其刀台, 发明, 2018, 第 4 作者, 专利号: ZL 201821474544.1
（ 18 ） 大视场光学显微图像成像装置及方法, 发明, 2018, 第 2 作者, 专利号: ZL 201811213274.3
（ 19 ） 显微序列图像拼接方法及装置, 发明, 2018, 第 2 作者, 专利号: ZL 201811213303.6
（ 20 ） 生物样品三维结构的构建方法及装置, 发明, 2018, 第 3 作者, 专利号: ZL 201811213305.5
（ 21 ） 基于序列切片的显微镜图像采集方法, 发明, 2020, 第 3 作者, 专利号: PCT/CN2016/104852
（ 22 ） 用于镀膜仪制备连续导电薄膜的装置, 发明, 2020, 第 3 作者, 专利号: ZL 201910956375.8

研究领域

"微观尺度脑连接图谱新技术研究，致力于海量电镜图像的高通量采集、实时处理、三维重建和智能分析等，基于脑连接图谱大数据对真实神经网络机制进行建模和阐释，为国家脑科学和类脑智能研究提供突触水平神经重建所需的技术服务、解决方案和共享平台。"

近期论文

（1） A common hub for sleep and motor control in the substantia nigra, Science, 2020, 其他（合作组作者）
（2） Dual Networks for High-Precision and High-Speed Registration of Brain Electron Microscopy Images, Brain Sciences, 2020, 通讯作者
（3） An Innovative Method for Screening and Evaluating the Degree of Diabetic Retinopathy and Drug Treatment Based on Artificial Intelligence Algorithms, Pharmacological Research, 2020, 通讯作者
（4） Automatic reconstruction of mitochondria and endoplasmic reticulum in electron microscopy volumes by deep learning, Frontiers in Neuroscience, 2020, 通讯作者
（5） SiamBOMB: A Real-time AI-based System for Home-cage Animal Tracking, Segmentation and Behavioral Analysis, IJCAI-PRICAI 2020, 2020, 通讯作者
（6） Quality metrology of carbon nanotube thin films and its application for carbon nanotube-based electronics, Nano Research, 2020, 其他（合作组作者）
（7） An Effective Encoder-Decoder Network for Neural Cell Bodies and Cell Nucleus Segmentation of EM Images, IEEE Engineering in Medicine and Biology Society(EMBC), 2019, 通讯作者
（8） Automatic Classification for the Type of Multiple Synapse Based on Deep Learning, IEEE Engineering in Medicine and Biology Society(EMBC), 2019, 通讯作者
（9） Electron Microscopic Sequential Images Stitching Based on Belief Propagation, International Conference on Graphic and Image Processing(ICGIP), 2019, 通讯作者
（10） Using Scale Information to Improve SIFT-Based Electron Microscope Image Registration Method, International Conference on Graphic and Image Processing(ICGIP), 2019, 通讯作者
（11） Brain Activity Regulates Loose Coupling between Mitochondrial and Cytosolic Ca Transients, Nature Communications, 2019, 其他（合作组作者）
（12） Scalable volumetric imaging for ultrahigh-speed brain mapping at synaptic resolution, National Science Review, 2019, 其他（合作组作者）
（13） Skeleton-based Image Registration of Serial Electron Microscopy Sections, SPIE Medical Imaging. International Society for Optics and Photonics, 2019, 通讯作者
（14） Deep Contextual Residual Network for Electron Microscopy Image Segmentation in Connectomics, 2018 IEEE International Symposium on Biomedical Imaging（ISBI）, 2018, 通讯作者
（15） A Novel 3D Connection Algorithm of Mitochondria from ATUM-SEM Stacks Based on Segmentation Information in Context, IEEE Engineering in Medicine and Biology Society(EMBC), 2018, 通讯作者
（16） Automatic Detection and Segmentation of Mitochondria from SEM Images using Deep Neural Network, IEEE Engineering in Medicine and Biology Society(EMBC), 2018, 通讯作者
（17） Large-area and highly uniform carbon nanotube film forhigh-performance thin film transistors, Nano Research, 2018, 其他（合作组作者）
（18） 基于深度学习的脑微观结构重建, Brain Microstructure Reconstruction Based on Deep Learning, 系统工程理论与实践, 2018, 通讯作者
（19） Fully Automatic Synaptic Cleft Detection and Segmentation From EM Images based on Deep Learning, International Conference on Brain-Inspired Cognitive System​(BICS), 2018, 通讯作者
（20） A Fast Forward 3D Connection Algorithm for Mitochondria and Synapse Segmentations from Serial EM Images, BioData Mining, 2018, 通讯作者
（21） A Refined Spatial Transformer Network, International Conference on Neural Information Processing, 2018, 通讯作者
（22） Correlative light and electron microscopy for complex cellular structures on PDMS substrates with coded micro-patterns, Lab on a Chip, 2018, 其他（合作组作者）
（23） Automatic mitochondria segmentation for EM data using a 3D supervised convolutional network, Frontiers in Neuroanatomy, 2018, 通讯作者
（24） Morphology-Retained Non-Linear Image Registration of Serial Electron Microscopy Sections, IEEE International Conference on Image Processing (ICIP), 2018, 通讯作者
（25） A Effective Fully Deep Convolutional Neural Networks for Mitochondria Segmentation Based on ATUM-SEM, SPIE Medical Imaging, 2018, 通讯作者
（26） Effective Automated Pipeline for 3D Reconstruction of Synapses Based on Deep Learning, BMC Bioinformatics, 2018, 通讯作者
（27） Formation mechanism of anodic titanium oxide in mixed electrolytes, Materials Research Bulletin, 2017, 通讯作者
（28） Large scale three-dimensional reconstruction of an entire Caenorhabditis elegans larva using AutoCUTS-SEM, Journal of Structural Biology, 2017, 其他（合作组作者）
（29） 3D reconstruction of synapses with deep learning based on EM Images, SPIE Medical Imaging, 2017, 通讯作者
（30） Learning with Coefficient-based Regularized Regression on Markov Resampling, IEEE Transactions on Neural Networks and Learning Systems, 2017, 其他（合作组作者）
（31） An Automated Pipeline for Bouton, Spine, and Synapse Detection of In vivo Two-photon Images of Mouse, Biodata Mining, 2017, 通讯作者
（32） 脑微观重建系统研究, Micro reconstruction system for brain, 系统工程理论与实践, 2017, 通讯作者
（33） Deep Learning and Shapes Similarity for Joint Segmentation and Tracing single Neurons in SEM images, SPIE Medical Imaging, 2017, 通讯作者
（34） An Automated Pipeline for Mitochondrial Segmentation on ATUM-SEM Stacks, Journal of Bioinformatics and Computational Biology, 2017, 通讯作者
（35） Neurons secrete miR-132-containing exosomes to regulate brain vascular integrity, Cell Research, 2017, 其他（合作组作者）
（36） Watershed learning merge tree used for segmenting neurons in SEM images, The 2017 IEEE International Conference on Mechatronics and Automation(ICMA), 2017, 通讯作者
（37） Automatically Segmenting and Reconstructing Neurons in SEM images, The 2016 IEEE International Conference on Mechatronics and Automation(ICMA), 2016, 通讯作者
（38） Wrinkle Image Registration for Serial Microscopy Sections, International Conference on Signal-Image Technology & Internet-Based Systems, 2015, 通讯作者
（39） Simulation of anodizing current-time curves and morphology evolution of TiO 2 nanotube arrays, J Solid State Electrochem, 2014, 通讯作者
（40） 还原剂对多孔阳极氧化铝纳米孔道结构的影响, Influence of Reducer on the Nanopore Structure of Porous Anodic Alumina, 物理化学学报, 2012, 通讯作者
（41） A Fast Acquisition System for Large-scale Optical Microscopic Integrated Circuit Chip Images Based on Thin Plate Spline, Proceedings of the 2012 International Conference on Sensors, Measurement and Intelligent Materials, Guilin, China, 2012, 通讯作者
（42） 多孔阳极氧化物的形成效率与纳米孔道的形成机理, Forming efficiency of porous anodic oxide and formation mechanism of nanopores, 物理学报, 2012, 通讯作者
（43） β展式的误差和函数, The Error-Sum Function of Beta Expansion , 数学的实践与认识, 2011, 通讯作者
（44） Image super-resolution based on image adaptive decomposition, Proc. of SPIE MIPPR 2011: Parallel Processing of Images and Optimization and Medical Imaging Processing, 2011, 通讯作者
（45） 经验模式分解算法的分析及其应用, 系统工程理论与实践, 2009, 通讯作者
学生培养