个人简历

招生专业
090801-水产养殖
071004-水生生物学
070703-海洋生物学
招生方向
海洋生物与生态，海洋生物多样性与进化
比较基因组学
分子进化
教育背景
1993-09--1997-12 法国国家自然历史博物馆 理学博士
1985-09--1988-06 中国科学院水生生物研究所 硕士
1979-09--1983-06 西南师范学院生物系 学士

工作简历
2004-05~2004-11,美国芝加哥大学生态与进化系, 高级访问学者
1993-09~1997-12,法国国家自然历史博物馆, 理学博士
1988-07~2011-07,中国科学院水生生物研究所, 研究实习员-二级研究员
1985-09~1988-06,中国科学院水生生物研究所, 硕士
1979-09~1983-06,西南师范学院生物系, 学士

教授课程
系统发育与生物地理学
鱼类学
奖励信息
（1） 中国科学院研究生院优秀教师, 一等奖, 院级, 2006
专利成果
（ 1 ） 一种深海诱捕摄像着陆器系统, 2014, 第 2 作者, 专利号: 专利号：201420202301.8
（ 2 ） 一种圆筒形实验鱼类固定装置, 2014, 第 2 作者, 专利号: 专利号：201420095585.5

发表著作
（ 1 ） 生物的时间系统树, The Timetree of Life, Oxford University Press, 2009-10, 第 5 作者
科研项目
（ 1 ） DNA 条码：重大项目课题, 主持, 国家级, 2011-01--2014-12
（ 2 ） 怒江鱼类受环境变化的影响研究, 主持, 国家级, 2011-01--2014-12
（ 3 ） 中国水产品DNA条形码数据库, 主持, 国家级, 2012-01--2015-12
（ 4 ） 青藏高原鱼类适应性状的解析, 主持, 部委级, 2015-01--2018-12
（ 5 ） 深海鱼类比较基因组学及其适应性进化, 主持, 部委级, 2015-01--2018-12
（ 6 ） 海斗深渊环境特征和生命演化, 主持, 国家级, 2018-07--2020-12
（ 7 ） 深渊鱼类的起源演化及其环境适应的分子机制, 主持, 国家级, 2019-01--2022-12
参与会议
（1）深渊狮子鱼环境适应的分子机制 中俄深海科学双边会议 2019-03-25
（2）中国淡水鱼类多样性历史 2014美国鱼类与两栖爬行类年会 2014-08-08
（3）中国淡水鱼类多样性及其DNA条形码 印度太平洋鱼类学大会 2013-06-06
（4）中国的淡水鱼类多样性及其基因组资源 国际鱼类基因组大会 何舜平 2010-09-03

研究领域

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近期论文

（1） Morphology and genome of a snailfish from the Mariana Trench provide insights into deep-sea adaptation, Nature Ecology & Evolution, 2019, 通讯作者
（2） Ancient duplications and functional divergence in the interferon regulatory factors of vertebrates provide insights into the evolution of vertebrate immune systems., Developmental Comparative Immunology, 2018, 通讯作者
（3） Evidence for Adaptation to the Tibetan Plateau Inferred from Tibetan Loach Transcriptomes, Genome Biol. Evol. 7(11):2970–2982, 2015, 通讯作者
（4） Analysis of the nicotinamide phosphoribosyltransferase family provides insight into vertebrate adaptation to different oxygen levels during the water-to-land transition, FEBS Journal, 2015, 通讯作者
（5） Evolutionary fate and implications of retrocopies in the African coelacanth genome, BMC Genomics, 2015, 通讯作者
（6） Analysis of hypoxia-inducible factor alpha polyploidization reveals adaptation to Tibetan plateau in the evolution of schizothoracine fish, BMC Evolutionary Biology, 2014, 通讯作者
（7） Comprehensive Transcriptome Analysis Reveals Accelerated Genic Evolution in a Tibet Fish, Gymnodiptychus pachycheilus, Genome Biol. Evol. 7(1):251–261, 2014, 通讯作者
（8） Integrating multi-origin expression data improves the resolution of deep phylogeny of ray-finned fish (Actinopterygii, SCIENTIFIC REPORTS, 2012, 通讯作者
（9） Cyprinid phylogeny based on Bayesian and maximum likelihood analyses of partitioned data: implications for Cyprinidae systematics , Cyprinid phylogeny based on Bayesian and maximum likelihood analyses of partitioned data: implications for Cyprinidae systematics , 2012, 通讯作者
（10） Basal Jawed Vertebrate Phylogenomics Using Transcriptomic Data from Solexa Sequencing , PLOS ONE, 2012, 通讯作者
（11） A phylogeographic, demographic and historical analysis of the short-tailed pit viper (Gloydius brevicaudus):evidence for early divergence and late expansion during the Pleistocene, Molecular Ecology, 2011, 通讯作者
（12） Parallel Expansions of Sox Transcription Factor Group B Predating the Diversifications of the Arthropods and Jawed Vertebrates, Plos One, 2011, 通讯作者
（13） Phylogenomic Analysis Resolves the Formerly Intractable Adaptive Diversification of the Endemic Clade of East Asian Cyprinidae (Cypriniformes), Plos One, 2010, 通讯作者
（14） Multiple source genes of HAmo SINE actively expanded and ongoing retroposition in cyprinid genomes relying on its partner LINE, BMC Evolutionary biology, 2010, 通讯作者
（15） Hox Genes of the Japanese Eel Anguilla japonica and Hox Cluster Evolution in Teleosts, Journal of Experimental Zoology, 2010, 通讯作者
（16） The youngest split in sympatric schizothoracine fish (Cyprinidae) is shaped by ecological adaptations in a Tibetan Plateau glacier lake, Molecular Ecology, 2009, 通讯作者
2015-01-01-今,湖北省暨武汉市动物学会, 理事长
2009-12-31-2019-12-31,中国动物学会, 常务理事