个人简历

招生专业
086000-生物与医药
0710Z2-计算生物学
招生方向
生物信息学
教育背景
2010-09--2013-09 德国波恩大学 自然科学博士学位
2004-09--2007-06 云南大学 理学硕士学位
2000-09--2004-06 云南大学 工学学士学位
工作简历
2018-07~现在, 中国科学院昆明植物所, 正高级工程师
2016-11~2018-06,云南省烟草农业科学研究院, 专业技术人员
2013-09~2016-10,德国科隆大学, 博士后
2009-07~2010-07,中国科学院北京基因组所, 助理研究员
2008-08~2009-06,中国科学院中德马普计算生物学伙伴所, 研究助理
2007-07~2008-07,中国科学院昆明动物所, 研究实习员
教授课程
生物信息学
科研项目
（ 1 ） 发展机器学习模型用于智能植物志的物种分类和鉴定, 主持, 部委级, 2019-01--2021-12
（ 2 ） 植物基因组从头组装和遗传变异分析平台的构建, 主持, 市地级, 2018-10--2020-09
（ 3 ） 大尺度区域生物多样性格局与生命策略, 参与, 部委级, 2018-10--2022-12

研究领域

"主要是发展基于机器学习和统计学的计算生物学模型来理解生物复杂性。"

近期论文

（1） Pan-cancer analysis of whole genomes, Nature, 2020, 其他（合作组作者）
（2） The evolutionary history of 2,658 cancers, Nature, 2020, 其他（合作组作者）
（3） Reconstructing evolutionary trajectories of mutation signature activities in cancer using TrackSig, Nature Communications, 2020, 其他（合作组作者）
（4） Inferring structural variant cancer cell fraction, Nature Communications, 2020, 其他（合作组作者）
（5） Integrative genomic profiling of large-cell neuroendocrine carcinomas reveals distinct molecular subtypes of high-grade neuroendocrine lung tumors, Nature Communications, 2018, 其他（合作组作者）
（6） Copy number analysis and inference of subclonal populations in cancer genomes using Sclust, Nature Protocols, 2018, 第 1 作者
（7） Two mouse models reveal an actionable PARP1 dependence in aggressive chronic lymphocytic leukemia, Nature Communications, 2017, 第 9 作者
（8） Transcriptomic profile of tobacco in response to Tomato zonate spot orthotospovirus infection, Virology Journal, 2017, 第 2 作者
（9） Comprehensive genomic profiles of small cell lung cancer, Nature, 2015, 第 4 作者
（10） netClass: an R-package for network based, integrative biomarker signature discovery, Bioinformatics, 2014, 第 1 作者
（11） Network and data integration for biomarker signature discovery via network smoothed T-statistics, PLoS ONE, 2013, 第 1 作者
（12） Prognostic gene signatures for patient stratification in breast cancer - accuracy, stability and interpretability of gene selection approaches using prior knowledge on protein-protein interactions, BMC Bioinformatics, 2012, 第 1 作者
（13） Biomarker gene signature discovery integrating network knowledge, Biology, 2012, 第 1 作者
2019-11-20-今,中国生物信息学学会, 理事