个人简历

学习经历： 1978年09月至1982年07月，浙江农业大学农学系 种子专业，学士 1986年01月至1990年01月，美国康奈尔大学植物科学系 植物生理学，博士 主要工作经历与任职情况： 1989年12月至1991年06月，美国华盛顿大学生物系，博士后 1991年06月至1992年06月，北京大学生物系，博士后 1992年07月至1994年02月，北京大学生命科学学院，副教授 1992年12月至2002年08月，蛋白质工程及植物基因工程国家重点实验室，副主任 1994年07月至今，北京大学生命科学学院，教授、博士生导师 1996年09月至1997年7月，美国加州伯克利大学植物基因表达中心，高级访问学者 2001年09月至今，教育部\

研究领域

主要通过研究陆地棉花纤维发育早期的功能基因组、转录组学及雷蒙德氏棉、亚洲棉功能基因组，探索纤维突起、伸长的分子机制及调控规律。通过大规模转录组学分析法，获得大量纤维突起或伸长阶段特异性表达基因（重点是棉花转录因子基因家族成员以及激素受体基因）,探索棉花基因功能鉴定的新方法。用RT-PCR等基因表达分析方法研究已克隆的基因在棉花发育过程中的器官、组织及发育时期等时空表达特性，推测这些基因在棉纤维发育过程中的作用。分离鉴定植物激素信号途径对棉纤维发育起重要调控作用编码关键转录因子的基因，阐明植物激素对纤维发育的关键作用。

近期论文

1. Li, F.G., Fan, G.Y., Wang, K.B., Sun, F.M., Yuan, Y.L., Song, G.L., Li, Q., Ma, Z.Y., Lu, C.R., Zou, C.S., Chen, W.B., Liang, X.M., Shang, H.H., Liu, W.G., Shi, C.C., Xiao, G.H., Gou, C.Y., Ye, W.W., Xu, X., Zhang, X.Y., Wei, H.L., Li, Z.F., Zhang, G.Y., Wang, J.Y., Liu, K. Kohel, R.J., Percy, R.G., Yu, J.Z., Zhu, Y.X*, Wang, J*. Yu, S.X*.. Genome sequence of the cultivated cotton Gossypium arboretum. Nature Genetics (2014) doi:10.1038/ng.2987 2. Li, Q., Xiao, G. H., and Zhu, Y. X.* Single-nucleotide resolution mapping of the Gossypium raimondii transcriptome reveals a new mechanism for alternative splicing of introns. Molecular Plant 7 (2014), 829-840. 3. Wang, K. B., Wang, Z. W., Li, F. G., Ye, W. W., Wang, J. Y., Song, G. L., Yue, Z., Cong, L., Shang, H. H., Zhu, S. L., Zou, C. S., Li, Q., Yuan, Y. L., Lu, C. R., Wei, H. L., Gou, C. Y., Zheng, Z. Q., Yin, Y., Zhang, X. Y., Liu, K., Wang, B., Song, C., Shi, N., Kohel, R. J., Percy, R. G., Yu, J. Z., Zhu, Y. X.*, Wang, J*. and Yu, S. X*. The draft genome of a diploid cotton Gossypium raimondii. Nature Genetics 44 (2012), 1098-1103. 4. Qin, Y. M. and Zhu Y. X.* How cotton fibers elongate: a tale of linear cell-growth mode. Curr. Opin. Plant Biol. 14 (2011), 106-111. 5. Pang, C.Y., Wang, H., Pang, Y., Xu, C., Jiao, Y., Qin, Y.M., Western, T.L., Yu, S.X. and Zhu, Y.X.* Comparative proteomics indicate that biosynthesis of pectic precursors is important for cotton fiber and Arabidopsis root hair elongation. Molecular Cellular Proteomics, 9 (2010), 2019-2033. 6. Han, P., Li, Q. and Zhu, Y. X.* Mutation of Arabidopsis BARD1 causes meristem defects by failing to confine WUSCHEL expression to the organizing center. Plant Cell 20 (2008), 1482-1493. 7. Qin, Y. M., Hu, C. Y., Pang, Y., Kastaniotis, A. J., Hiltunen, J. K. and Zhu, Y. X.* Saturated very-long-chain fatty acids promote cotton fiber and Arabidopsis cell elongation by activating ethylene biosynthesis. Plant Cell 19 (2007), 3692-3704. 8. Li, H. B., Qin, Y. M., Pang, Y., Song, W. Q. and Zhu, Y. X.* A cotton ascorbate peroxidase modulates the stead-state level of H2O2 during fiber cell development. New Phytol. 175 (2007), 462-471. 9. Qu, L. J. and Zhu, Y. X.* Transcription factor families in Arabidopsis: major progress and outstanding issues for future research. Curr. Opin. Plant Biol. 9 (2006), 544-549. 10. Shi, Y. H., Zhu, S. W., Mao, X., Feng, J. X., Qin, Y. M., Zhang, L., Cheng, J., Wei, L., Wang, Z. Y. and Zhu, Y. X.* Transcriptome profiling, molecular biological and physiological studies reveal a major role for ethylene in cotton fiber cell elongation. Plant Cell 18 (2006), 651-664. 11. Ji, S. J., Lu, Y. C., Feng, J. X., Wei, G., Li, J., Shi, Y. H., Fu, Q., Liu, D., Luo, J. C. and Zhu, Y. X.* Isolation and analyses of genes preferentially expressed during early cotton fiber development by subtractive PCR and cDNA array. Nucleic Acids Res. 31 (2003), 2534-2543. 12. Zhu, Y. X., Tepperman, J. M., Fairchild, C. and Quail, P. H. Phytochrome B binds with greater apparent affinity than phytochrome A to the basic helix-loop-helix factor PIF3 in a reaction requiring the PAS domain of PIF3. Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 97 (2000), 13419-13424.