个人简历

学历简介：
博士 2006-9 至 2009-6 中国海洋大学 海洋生物学
硕士 2003-9 至 2006-7 山东农业大学 动物遗传育种与繁殖学
学士 1999-9 至 2003-7 山东农业大学 水产养殖学
工作经历：
2019-10 至 现在 汕头大学， 海洋生物研究所所长
2019-7 至 现在 汕头大学， 理学院党委委员
2016-6 至 现在 汕头大学， 教授，博士生导师
2013-9 至 2014-9 加州理工学院， 国家公派访问学者
2012-1 至 2016-4 中国水产科学研究院东海水产研究所， 副研究员，党支部副书记，硕士生导师
2009-7 至 2011-12 中国水产科学研究院东海水产研究所， 助理研究员
担任课程：
本科生：普通生物学（动物学部分）；水产动物遗传育种学；海洋蟹类基因组奥秘；生物学总论；动物学
硕士生：海洋基因组学；水产动物性别决定与调控技术
博士生：海洋动物分子生物学；海洋基因组学；水产动物性别决定与调控技术

研究领域

海洋动物养殖、育种与生物技术"专利及软件著作
[ 1 ] 马洪雨，吴清洋，苗贵东，郑怀平，李升康，游翠红，王树启；一种远海梭子蟹多态性微卫星分子标记及鉴定方法与应用，国家发明专利，2020.08，ZL201711267397.0；
[ 2 ] 马洪雨，夏连军，邹雄，马凌波，马春艳，陆建学，蒋伟，李淑娟，刘月星；一种锈斑蟳微卫星标记的快速检测方法，国家发明专利，2015.04，ZL201310211317.5；
[ 3 ] 马洪雨，夏连军，邹雄，马凌波，马春艳，陆建学，蒋伟，李淑娟，刘月星；一种锈斑蟳微卫星分子标记的筛选方法，国家发明专利，2015.03，ZL201310210311.6；
[ 4 ] 马洪雨，崔海玉，马凌波，马春艳；一种拟穴青蟹微卫星分子标记的筛选方法，国家发明专利，2012.12，ZL201010575043.4；
[ 5 ] 马洪雨，马凌波，马春艳；一种快速鉴定青蟹属4种青蟹的PCR方法，国家发明专利，2012.08，ZL201010140012.6；
[ 6 ] 马洪雨，马凌波，马春艳；拟穴青蟹功能基因来源微卫星标记的快速检测方法，国家发明专利，2012.03，ZL201010134061.9；
[ 7 ] 马洪雨，石西，吴清洋，黄智，邱必巡；一种海洋蟹类种蟹池的排水装置，实用新型专利，2019. 07，2018219500370；
[ 8 ] 马洪雨，陆建学，石西，张建生，游翠红，吴清洋，杨小龙，林帆；一种拟穴青蟹人工育苗的幼体孵化辅助装置，实用新型专利，2018.03，ZL2017208750255；
[ 9 ] 马洪雨，张胜茂，马凌波，马春艳；拟穴青蟹体质量预测系统V1.0，软件著作权，2014.11，2014SR180798；
承担项目：
[ 1 ] 国家重点研发计划“蓝色粮仓科技创新”重点专项， 水产养殖生物性别和发育的分子基础与调控机制-子课题-拟穴青蟹基因组解析与性别特异SNP标记鉴定研究，主持；(编号：2018YFD0900201-3，执行期：2018.12-2022.12，在研)，
[ 2 ] 国家自然科学基金面上项目， 拟穴青蟹染色体性别决定机制研究，主持；(编号：31772837，执行期：2018.01-2021.12，在研)，
[ 3 ] 国家“万人计划”高层次人才特殊支持项目， 拟穴青蟹基因组与遗传育种，主持；(编号：执行期：2015.12-2018.12，完成)，
[ 4 ] 国家自然科学基金青年项目， 拟穴青蟹生长性状相关分子标记、QTLs发掘及定位研究，主持；(编号：31001106，执行期：2011.01-2013.12，完成)，
[ 5 ] 国家留学人员科技活动择优资助项目， 拟穴青蟹IGFR2基因启动子区甲基化修饰及调控mRNA转录的机制研究，主持；(编号：执行期：2015.03-2017.02，完成)，
[ 6 ] 国家留学基金委留学基金项目， 赴美国加州理工学院做访问学者，主持；(编号：执行期：2013.09-2014.09，完成)，
[ 7 ] 广东省重大人才工程项目， 广东省“特支计划”科技创新领军人才项目，主持；(编号：2019TX05N067，执行期：2019.12-2022.12，在研)，
[ 8 ] 广东省科技计划项目（国际科技合作领域）， 青蟹软壳蟹培育技术创新与示范推广，主持；(编号：2018A050506080，执行期：2018.12-2020.11，在研)，
[ 9 ] 广东省促进经济发展专项资金项目（现代渔业发展用途）， 青蟹全人工规模化扩繁与生态养殖技术示范推广，子课题主持；(编号：粤农2019B4，执行期：2019.06-2021.06，在研)，
[ 10 ] 广东省促进经济发展专项资金项目（现代渔业发展用途）， 池塘工程化循环水养殖技术的创新与应用，主持；(编号：SDYY-2018-11，执行期：2018.07-2019.06，完成)，
[ 11 ] 广东省扬帆计划引进紧缺拔尖人才计划项目， 青蟹性别特异分子标记筛选与性别鉴定技术的构建及应用，主持；(编号：执行期：2017.04-2020.03，完成)，
[ 12 ] 上海市科技支撑项目， 基于QTLs的拟穴青蟹分子辅助育种技术构建与应用，主持；(编号：15391900900，执行期：2015.07-2017.12，完成)，
[ 13 ] 上海市自然科学基金项目， IGF2基因多态性及其调控拟穴青蟹生长发育的分子机制研究，主持；(编号：14ZR1449700，执行期：2014.07-2017.06，完成)，
[ 14 ] 汕头市科技计划项目， 拟穴青蟹池塘生态育苗技术研究与示范推广，主持；(编号：2016-44，执行期：2017.01-2018.12，完成)，
[ 15 ] 汕头大学科研启动经费项目， 基于组学的拟穴青蟹性腺发育相关基因和LncRNAs鉴定与功能研究，主持；(编号：NTF17006，执行期：2017.06-2020.05，完成)，
[ 16 ] 中央级科研院所基本科研业务费重点项目， 采用群组和家系选育策略培育拟穴青蟹快速生长新品种，主持；(编号：2014Z01-3，执行期：2014.01-2016.12，完成)，
[ 17 ] 中央级科研院所基本科研业务费面上项目， 拟穴青蟹快速生长良种选育基础群构建，主持；(编号：2011M05，执行期：2011.10-2013.09，完成)，"

近期论文

[ 1 ] Zhang Yin, Wu Qingyang, Fang Shaobin, Li Shengkang, Zheng Huaiping, Zhang Yueling, Mhd Ikhwanuddin, Ma Hongyu*；mRNA profile provides novel insights into stress adaptation in mud crab megalopa, Scylla paramamosain after salinity stress；BMC Genomics, 2020, 21: 559；
[ 2 ] Khor Waiho, Hanafiah Fazhan, Zhang Yin, Nor Afiqah-Aleng, Julia Hwei Zhong Moh, Mhd Ikhwanuddin, Marina Hassan, Mohd Husin Norainy, Ma Hongyu*；Gonadal transcriptomic analysis of the mud crab Scylla olivacea infected with rhizocephalan parasite Sacculina beauforti；Genomics, 2020, 112 (5), 2959-2969；
[ 3 ] Wang Yue, Wang Xuepeng, Zhang Bin, Li Zhimin, Yang Liguo, Li Xincang*, Ma Hongyu*；A lysin motif-containing protein (SpLysMD3) functions as a PRR involved in the antibacterial responses of mud crab, Scylla paramamosain；Fish & Shellfish Immunology, 2020, 97: 257-267；
[ 4 ] Wu Qingyang, Khor Waiho, Huang Zhi, Li Shengkang, Zheng Huaiping, Zhang Yueling, Mhd Ikhwanuddin, Lin Feng, Ma Hongyu*；Growth performance and biochemical composition dynamics of ovary, hepatopancreas and muscle tissues at different ovarian maturation stages of female mud crab, Scylla paramamosain；Aquaculture, 2020, 515: 734560；
[ 5 ] Khor Waiho, Hanafiah Fazhan, Zhang Yin, Li Shengkang, Zhang Yueling, Zheng Huaiping, Mhd Ikhwanuddin, Ma Hongyu*；Comparative profiling of ovarian and testicular piRNAs in the mud crab Scylla paramamosain；Genomics, 2020, 112 (1): 323-331；
[ 6 ] Fang Shaobin, Zhang Yin, Shi Xi, Zheng Huaiping, Li Shengkang, Zhang Yueling, Hanafiah Fazhan, Khor Waiho, Tan Huaqiang, Mhd Ikhwanuddin, Hongyu Ma*；Identification of male-specific SNP markers and development of PCR-based genetic sex identification technique in crucifix crab (Charybdis feriatus) with implication of an XX/XY sex determination system；Genomics, 2020, 112 (1): 404-411；
[ 7 ] Lin Jiali, Shi Xi, Fang Shaobin, Zhang Yin, You Cuihong, Ma Hongyu*, Lin Fan*；Comparative transcriptome analysis combining SMRT and NGS sequencing provides novel insights into sex differentiation and development in mud crab (Scylla paramamosain)；Aquaculture, 2019, 513: 734447；
[ 8 ] Wu Qingyang, Shi Xi, Fang Shaobin, Xie Zhuofang, Guan Mengyun, Li Shengkang, Zheng Huaiping, Zhang Yueling, Mhd Ikhwanuddin, Ma Hongyu*；Different biochemical composition and nutritional value attribute to salinity and rearing period in male and female mud crab Scylla paramamosain；Aquaculture, 2019, 513: 734417；
[ 9 ] Khor Waiho, Shi Xi, Hanafiah Fazhan, Li Shengkang, Zhang Yueling, Zheng Huaiping, Liu Wenhua, Fang Shaobin, Mhd Ikhwanuddin, Ma Hongyu*；High-density genetic linkage maps provide novel insights into ZW/ZZ sex determination system and growth performance in mud crab (Scylla paramamosain)；Frontiers in Genetics, 2019, 10: 298；
[ 10 ] Khor Waiho, Hanafiah Fazhan, Zhang Yin, Zhang Yueling, Li Shengkang, Zheng Huaiping, Liu Wenhua, Mhd Ikhwanuddin, Ma Hongyu*；Gonadal microRNA expression profiles and their potential role in sex differentiation and gonadal maturation of mud crab Scylla paramamosain；Marine Biotechnology, 2019, 21: 320-334；
[ 11 ] Shi Xi, Lu Jianxue, Wu Qingyang, Khor Waiho , Jude Juventus Aweya, Hanafiah Fazhan, Zhang Yueling, Li Shengkang, Zheng Huaiping, Lin Fan, You Cuihong, Mhd Ikhwanuddin, Ma Hongyu*；Comparative analysis of growth performance between female and male mud crab Scylla paramamosain crablets: Evidences from a four-month successive growth experiment；Aquaculture, 2019, 505: 351-362；
[ 12 ] Shi Xi, Khor Waiho, Li Xincang, Mhd Ikhwanuddin, Miao Guidong, Lin Fan, Zhang Yueling, Li Shengkang, Zheng Huaiping, Liu Wenhua, Jude Juventus Aweya, Ghazali Azmie, Juliana C. Baylon, Emilia T. Quinitio, Ma Hongyu*；Female-specific SNP markers provide insights into a WZ/ZZ sex determination system for mud crab Scylla paramamosain, S. tranquebarica and S. serrata with a rapid method for genetic sex identification；BMC Genomics, 2018, 19: 981；
[ 13 ] Zhang Yin, Miao Guidong, Wu Qingyang, Lin Fan, You Cuihong, Wang Shuqi, Jude Juventus Aweya, Ma Hongyu*；Transcriptome sequencing and molecular markers discovery in the gonads of Portunus sanguinolentus；Scientific Data, 2018, 5: 180131；
[ 14 ] Khor Waiho, Hanafiah Fazhan, Emilia T. Quinitio, Juliana C. Baylon, Yushinta Fujaya, Ghazali Azmie, Wu Qingyang, Shi Xi, Mhd Ikhwanuddin, Ma Hongyu*；Larval rearing of mud crab (Scylla): What lies ahead；Aquaculture, 2018, 493:37-50；
[ 15 ] Zhang Yin, Miao Guidong, Hanafiah Fazhan, Khor Waiho, Zheng Huaiping, Li Shengkang, Mhd Ikhwanuddin, Ma Hongyu*；Transcriptome-seq provides insights into sex-preference pattern of gene expression between testis and ovary of the crucifix crab (Charybdis feriatus)；Physiological Genomics, 2018, 50 (5): 393-405.；
[ 16 ] Hanafiah Fazhan, Khor Waiho, Hin Boo Wee, Mohd Agos Surzanne, Ma Hongyu*, Mhd Ikhwanuddin；Predicting the sacculinid Sacculina beauforti infection status of the orange mud crab Scylla olivacea by discriminant analysis；Aquaculture, 2018, 491: 128-134；
[ 17 ] Yang Xiaolong, Ikhwanuddin Mhd, Li Xincang, Lin Fan, Wu Qingyang, Zhang Yueling, You Cuihong, Liu Wenhua, Cheng Yinwei, Shi Xi, Wang Shuqi, Ma Hongyu*；Comparative transcriptome analysis provides insights into differentially expressed genes and long non-coding RNAs between ovary and testis of the mud crab (Scylla paramamosain)；Marine Biotechnology, 2018, 20 (1): 20-34；
[ 18 ] Hou Zhiguo, Wang Yuan, Hui Kaimin, Fang Wenhong, Zhao Shu, Zhang Jingxiao, Ma Hongyu*, Li Xincang；A novel anti-lipopolysaccharide factor SpALF6 in mud crab Scylla paramamosain exhibiting different antimicrobial activity from its single amino acid mutant；Developmental and Comparative Immunology, 2017, 72: 44-56.；
[ 19 ] Ma Hongyu, Ma Chunyan, Li Chenhong, Lu Jianxue, Zou Xiong, Gong Yangyang, Wang Wei, Chen Wei, Ma Lingbo, Xia Lianjun；First mitochondrial genome for the red crab (Charybdis feriata) with implication of phylogenomics and population genetics；Scientific Reports, 2015, 5: 11524.；
[ 20 ] Ma Hongyu, Cui Haiyu, Ma Chunyan, Ma Lingbo；High genetic diversity and low differentiation in mud crab (Scylla paramamosain) along southeastern coast of China revealed by microsatellite markers；Journal of Experimental Biology, 2012, 215: 3120-3125.；
汕头大学-马来西亚登嘉楼大学虾蟹贝类联合实验室中方负责人；马来西亚登嘉楼大学Visiting Professor（2019.10-2021.09）；马来西亚登嘉楼大学兼职博士生导师；青岛海洋科学与技术试点国家实验室固定成员；国家科技专家库专家；广东省科技厅科技咨询专家库专家；汕头市科技专家库专家；广东省省级农业科技特派员；汕头市第一批农村科技特派员；Aquaculture、Marine Biotechnology、Molecular Ecology等20余种国内外学术期刊审稿专家
中国水产学会第十届理事会水产生物技术专业委员会委员；中国青年科技工作者协会第六届理事会理事；广东水产种业创新联盟首届专家委员会委员；广东省遗传学会第十届理事会理事；广东省遗传学会青年委员会委员；广东省生物化学与分子生物学会青年委员；汕头市青年科技工作者协会第八届副会长、理事；汕头市青年联合会第十一届委员会常务委员；广东省基础与应用基础研究基金委员会第一届学科咨询专家组专家（生命学科）；国家自然科学基金通讯评审专家；广东省自然科学基金重点项目会评专家；教育部学位中心博士学位论文抽查通讯评议专家；浙江省基础公益研究计划项目同行评议专家；Frontiers in Physilogy编委；Frontiers in Marine Science编委