个人简历

教育背景：
2011/09-2016/06吉林大学计算机科学与技术学院博士
2008/09-2011/06吉林大学计算机科学与技术学院硕士
2004/11-2006/07吉林大学生命科学学院第二学位（生物技术专业）
2004/09-2008/06吉林大学计算机科学与技术学院本科
2014/07-2014/12东芬兰大学健康科学学院交换生
2010/08-2011/02东芬兰大学健康科学学院交换生

工作经历：
2016/07-2019/06澳门大学健康科学学院博士后研究员

研究领域

机器学习、生物大数据分析、数据整合与挖掘、疾病生物标志物挖掘、非编码RNA等"主要研究方向为机器学习、生物大数据分析、数据整合与挖掘、疾病生物标志物挖掘、非编码RNA等。长期从事基于生物医学大数据的精准医学、基因组学方法学的研究，开发相应的生物信息学工具和数据库。
主持或参与的科研项目：
1.澳门大学多年研究项目，MYRG2016-00101-FHS，“非经典非编码小RNA的数据库构建，表达分析与生物标志物挖掘”，2017/01-2019/12，147万澳门元，参加
2.国家自然科学基金青年科学基金项目，61602207，开放获取生物医学文献的实体关系抽取，2017/01-2020/12，20万元，参加
3.国家自然科学基金面上项目，61572227，胰腺癌体液肿瘤标志物的系统挖掘与机理分析，2016/01-2019/12，65万元，参加
4.国家自然科学基金面上项目，61572228，永恒语言学习关键算法研究，2016/01-2019/12，66万元，参加
5.国家自然科学基金面上项目，61472158，全基因组重测序数据高维SNP相互作用研究，2015/01-2018/12，80万元，参加
6.国家自然科学基金面上项目，11372117，微机电系统多尺度力学问题研究与实验验证，2014/01-2017/12，85万，参加
7.国家自然科学基金面上项目，61272207，基于农作物高通量表达谱数据的特征选择与分子网络构建的评估算法，2013/01-2016/12，80万元，参加
8.教育部博士点基金，20120061120106，基于表达数据的癌症miRNA标志物预测及网络构建研究，2013/01-2014/12，4万元，参加
9.吉林省科技厅国际合作项目，20120730，结肠癌与食道癌早期诊断的尿液中蛋白标志物预测，2012/01-2014/12，参加
10.国家自然科学基金面上项目，61073075，农艺性状及相关基因关联网络若干基础问题研究，2011/01-2013/12，38万元，参加"

近期论文

1.ChenL,SunHY,WangCL,YangY,ZhangMLandWongG.miRNAArmSwitchingIdentifiesNovelTumourBiomarkers.Ebiomedicine,2018.(SCI,IF=6.68)
2.ChenL,HeikkinenL,WangC,etal.TrendsinthedevelopmentofmiRNAbioinformaticstools.BriefingsinBioinformatics,2018.(SCI,IF=9.101)
3.ChenL,HeikkinenL,WangC,etal.miRToolsGallery:AmicroRNAbioinformaticsresourcesdatabaseportal.Database(Oxford),2018.(SCI,IF=3.683)
4.ChenL,WongG.TranscriptomeInformatics.EncyclopediaofBioinformaticsandComputationalBiology,2018.(Chapter)
5.ChenL,WongG.NoveltumorbiomarkerbasedonisomiRexpressionprofiles.2017IEEEInternationalConferenceonBioinformaticsandBiomedicine(BIBM).IEEE,2017:2328-2329.(EI,PosterPaper)
6.ChenL,HeikkinenL,EmilyKnottK,etal.EvolutionaryconservationandfunctionofthehumanembryonicstemcellspecificmiR-302/367cluster.CompBiochemPhysiolPartDGenomicsProteomics,2015,16:83-98.(SCI,IF=2.573)
7.ChenL,DuW,WangY,etal.SilhouetteIndexSupervisedAffinityPropagationClustering.JournalofBionanoscience,2013,7(4):447-452(6).(EI)
8.WangCL*,ChenL*,YangY,ZhangML,WongG.IdentificationofpotentialbloodbiomarkersforParkinson’sdiseasebygeneexpressionandDNAmethylationdataintegrationanalysis.ClinicalEpigenetics,2019.(SCI,IF=5.496,co-firstauthor)
9.WangCL*,ChenL*,YangY,etal.Identificationofbladdercancerprognosticbiomarkersusinganageinggene-relatedcompetitiveendogenousRNAnetwork.Oncotarget,2017,8(67):111742.(SCI,co-firstauthor)
10.SunHY,ChenL,CaoS,LiangY,XuY.WarburgEffectsinCancerandNormalProliferatingCells:TwoTalesoftheSameName.Genomics,Proteomics&Bioinformatics,2018.(SCI,IF=6.597)
11.WangJ,ChenL,WangY,etal.Acomputationalsystemsbiologystudyforunderstandingsalttolerancemechanisminrice.PLoSOne,2013,8(6):e64929.(SCI,IF=2.776)
12.WangS,WangY,ZhangQ,WuS,NgC,UngvariG,ChenL,etal.Cognitivebehavioraltherapyforpost-strokedepression:Ameta-analysis.JournalofAffectiveDisorders,2018.(SCI,IF=4.084)
13.SunHY,LiangYC,WangY,ChenL,DuW,JiangYXandShiXH.LinkPredictionBasedonExtendedLocalPathGaininProtein-ProteinInteractionNetwork.TechnicalGazette,2019,26(1).(SCI,IF=0.644)
14.WangC,SaarV,LeungKL,ChenL,etal.Humanamyloidβpeptideandtauco-expressionimpairsbehaviorandcausesspecificgeneexpressionchangesinCaenorhabditiselegans.NeurobiologyofDisease,2017.(SCI,IF=5.16)
15.JiangY,WangY,PangW,ChenL,etal.Essentialproteinidentificationbasedonessentialprotein-proteininteractionpredictionbyIntegratedEdgeWeights.Methods,2015,83:51-62.(SCI,IF=3.782)
16.MengD,BaiL,LiangY,DuW,WangYandChenL.IdentifyingintronicmiRNAandmRNAregulatorynetworkinrenalcellcarcinomabypairedexpressiondata.JournalofBionanoscience,2013,7(5):551-559.(EI)
17.SunH,LiangY,ChenL,etal.AnImprovedSumofEdgeClusteringCoefficientMethodforEssentialProteinIdentification.JournalofBionanoscience,2013,7(4):386-390.(EI)
18.SunY,WangY,ChenL,etal.ImprovedFilterFeatureSelectionMethodsbySamplesLocalization.JournalofBionanoscience,2013,7(4):371-377.(EI)
19.CuiQL,TangC,XuGP,WuCG,SXH,LiangYC,ChenL,etal.SurprisinglyPopularAlgorithm-BasedComprehensiveAdaptiveTopologyLearningPSO.2019IEEECongressonEvolutionaryComputation(CEC).(EI)