个人简历

郑杰，信息学院副教授，目前在学院担任智能医学信息研究中心主任、招生委员会主任。
郑杰博士于2000年6月获得浙江大学计算机科学与工程学士学位（省级优秀毕业生），于2006年7月在美国加州大学河滨分校获得计算机科学与工程博士学位。2006年8月至2011年2月，郑博士在美国国立卫生研究院（NIH）下属国家生物技术信息中心（NCBI）从事博士后研究。之后，他在新加坡南洋理工大学计算机科学与工程学院担任助理教授，同时担任新加坡科技研究局（A*STAR）基因组研究所（GenomeInstituteofSingapore）客座研究员。郑杰博士于2018年6月加盟上海科技大学信息科学与技术学院任副教授。
郑杰博士已发表50多篇杂志论文（其中14篇影响因子5以上）及40多篇会议论文。他还担任多个国际学术会议程序委员和审稿人（包括两个会议的程序委员会共同主席），并每年多次为核心期刊审稿。他在新加坡主持完成3个国家级科研项目（总计两百多万新币），并参与其它10多个合作项目。2015年郑博士作为数学建模教练的南洋理工大学团队在国际基因工程大赛（iGEM）获得金牌。他还获得2017年国际生物信息学大会（InCoB）最佳论文奖（金牌）。郑博士曾连续两次获得南洋理工大学“优秀教师奖”提名

研究领域

数据科学
生物信息学
健康医疗大数据
人工智能

近期论文

KetHingChong,SandhyaSamarasinghe,DonKulasiri*,JieZheng,“Mathematicalmodellingofcoreregulatorymechanisminp53proteinthatactivatesapoptoticswitch”,JournalofTheoreticalBiology,vol.462,pp.134-147,February2019(IF=1.833).
YongLiu,MinWu*,ChenghaoLiu,Xiao-LiLi,JieZheng,“SL2MF:PredictingsyntheticlethalityinhumancancersviaLogisticMatrixFactorization”,IEEE/ACMTransactionsonComputationalBiologyandBioinformatics(TCBB),inpress,2019(IF=2.428).
HaifenChen,DevamuniA.K.Maduranga,PiyushkumarMundra,JieZheng,“Bayesiandatafusionofgeneexpressionandhistonemodificationprofilesforinferenceofgeneregulatorynetwork”,IEEE/ACMTransactionsonComputationalBiologyandBioinformatics(TCBB),PP(99):1,2019(IF=2.428)
LichunMa,JieZheng,“Single-cellgeneexpressiondataanalysisrevealsbeta-celldysfunctionanddeficitmechanismsintype2diabetes”,BMCBioinformatics,vol.19(Suppl19),p.515,2018(specialissueofGIW2018)(IF=2.213).
JingGuo,JieZheng,“HopLand:Single-cellpseudotimerecoveryusingcontinuousHopfieldnetworkbasedmodelingofWaddington’sepigeneticlandscape”,Bioinformatics,vol.33,no.14,pp.i102–i109(specialissueofflagshipconferenceISMB/ECCB2017,acceptancerate16.5%),2017(IF=7.307).
LichunMa,JieZheng,“Apolynomialbasedmodelforcellfatepredictioninhumandiseases”,BMCSystemsBiology,vol.11(Suppl7),pp.126,2017(BestPaperAward,GoldMedal,the16thInternationalConferenceonBioinformatics(InCoB2017)).
JingGuo,FengLin,XiaomengZhang,VivekTanavde,JieZheng,“NetLand:quantitativemodelingandvisualizationofWaddington’sepigeneticlandscapeusingprobabilisticpotential”,Bioinformatics,vol.33,no.10,pp.1583–1585,2017(IF=7.307).
JingGuo,HuiLiu,JieZheng,“SynLethDB:syntheticlethalitydatabasetowarddiscoveryofselectiveandsensitiveanticancerdrugtargets”,NucleicAcidsResearch,vol.44,no.D1,pp.D1011–D1017,2016(IF=10.162).
HaifenChen,JingGuo,ShitalKMishra,PaulRobson,MahesanNiranjan,JieZheng,“Single-celltranscriptionalanalysistouncoverregulatorycircuitsdrivingcellfatedecisionsinearlymousedevelopment”,Bioinformatics,vol.31,no.7,pp.1060–1066,2015(IF=7.307).
Jian-PingMei,Chee-KeongKwoh,PengYang,Xiao-LiLi,JieZheng,“Drug-TargetInteractionPredictionbyLearningfromLocalInformationandNeighbors”,Bioinformatics,vol.29,no.2,pp.238-245,2013(IF=7.307).