个人简历

教育背景\r
北京中医药大学 医学博士（1998.9－2001.7）\r
皖南医学院 医学硕士（继承家族医学-国家非物质文化遗产）（1995.9－1998.7）\r
北京中医药大学 医学学士（1990.9－1995.7）\r
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工作履历\r
清华大学 北京市中医药交叉研究所所长（2020.12至今）\r
清华大学 教授 （2009.12至今）\r
清华大学 博士生导师 （2008.9至今）\r
清华信息科技国家实验室（筹）生物信息学研究部 副主任 （2006.2至今）\r
清华大学自动化系、生物信息学教育部重点实验室 副研究员 （2004.12－2009.11）\r
清华大学自动化系、生物信息学教育部重点实验室 讲师 （2003.8－2004.12）\r
清华大学自动化系、生物信息学教育部重点实验室 博士后 （2001.9－2003.8）\r
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学术兼职\r
世界中医药学会联合会网络药理学专业委员会 会长\r
中国生物工程学会生物医药大数据专委会 主任委员\r
中国药理学会网络药理学专业委员会 副主任委员\r
中国研究型医院学会 生物标志物专业委员会 副主任委员\r
中华中医药学会 中医药防治重大疾病基础研究平台专家委员会 副主任委员

研究领域

"肿瘤等复杂疾病的生物网络与中西医精准防治\r
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中医药网络药理学的理论、方法与应用\r
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近期论文

Hou S, Zhang P, Yang K, Wang L, Ma C, Li Y, Li S*. Decoding multilevel relationships with the human tissue-cell-molecule network. Briefings in Bioinformatics 2022; bbac170\r
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Zhang Y, Chen L, Li S*. CIPHER-SC: Disease-Gene Association Inference Using Graph Convolution on a Context-Aware Network with Single-Cell Data. IEEE/ACM Transactions on Computational Biology and Bioinformatics 2022;19(2):819-829.\r
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Li S*. Network Pharmacology Evaluation Method Guidance - Draft. World Journal of Traditional Chinese Medicine 2021;7(1):146-154.\r
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Zhou W, Yang K, Zeng J, Lai X, Wang X, Ji C, Li Y, Zhang P, Li S*. FordNet: recommending traditional Chinese medicine formula via deep neural network integrating phenotype and molecule. Pharmacological Research 2021:105752 (Best Research Articles Published in the Journal in 2020/2021)\r
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Zhou W, Lai X, Wang X, Yao X, Wang W, Li S*. Network pharmacology to explore the anti-inflammatory mechanism of Xuebijing in the treatment of sepsis. Phytomedicine 2021;85:153543\r
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Sun J, Wang X, Xu R, Mao D, Shen D, Wang X, Qiu Y, Han Y, Lu X, Li Y, Che Q, Zheng L, Peng P, Kang X, Zhu R, Jia Y, Wang Y, Liu L, Chang Z, Ji J, Wang Z, Liu Q, Li S*, Sun F*, Ni J*. HP1c regulates development and gut homeostasis by suppressing Notch signaling through Su(H). EMBO Reports 2021;22(4):e51298\r
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Yuan Z, Zhou Q, Cai L, Pan L, Sun W, Qumu S, Yu S, Feng J, Zhao H, Zheng Y, Shi M, Li S, Chen Y*, Zhang XR*, Zhang MQ*. SEAM: a Spatial single nuclEar metAboloMics method for dissecting tissue microenvironment. Nature Methods 2021; 18(10):1223-1232\r
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Guo J*, Zhang P, Zhou L, You L, Liu Q, Zhang Z, Sun B, Liang Z, Lu J, Yuan D, Tan A, Sun J, Liao Q, Dai M, Xiao G, Li S*, Zhang T*. Prognostic and predictive value of a five-molecule panel in resected pancreatic ductal adenocarcinoma: A multicenter study. EBioMedicine 2020; 55: 102767\r
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Ding Q, Hou S, Zu S, Zhang Y, Li S*. VISAR: an interactive tool for dissecting chemical features learned by deep neural network QSAR models. Bioinformatics 2020;36(11):3610-3612.\r
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Zhang P, Yang M, Zhang Y, Xiao S, Tai X, Tan A, Du S, Li S*. Dissecting the single-cell transcriptome network underlying gastric premalignant lesions and early gastric cancer. Cell Reports 2019; 27,1934-1947（F1000 \