个人简历

教育经历：
2011年9月-2017年1月 北京大学，生命科学学院，王忆平教授实验室，理学博士
2007年9月-2011年6月 南京农业大学，生命科学学院，国家生命科学与技术人才培养基地班，理学学士
工作经历：
2017年2月- 至今 华中师范大学，生命科学学院，副教授
2013年10月- 2015年10月 美国加州大学圣地亚哥分校（UCSD），定量生物学中心，访问学者
荣誉或奖励
2017年12月 湖北省楚天学者计划 楚天学子
2017年1月 优秀毕业生，北京大学
2011年6月 优秀毕业生，南京农业大学
荣誉：
湖北省楚天学者计划 楚天学子称号
华中师范大学 桂子青年学者

研究领域

本课题组的研究方向为微生物合成与定量生物学,该领域目前是国际领域的研究热点，研究思路处于定量生物学与经典的分子生物学的交叉，涉及到多学科的研究理论策略。我们的研究主要集中于（但不局限于）细菌。我们希望建立一个理解细菌的综合性框架体系，进而可以预测细菌这个系统的“运作模式”（如其对各种生长环境的生理响应），我们关注但不强调特定的细菌分子调控细节。
经典的分子生物学主要采用“自底而上”（bottom up），“各个击破”的策略来研究生物体。其主要研究特定的蛋白或者信号途径的作用机制及其生物学意义。然而由于生物体过于复杂，包含了太多的分子作用细节以及未知的参数，“Bottom up”的研究策略很难上升到整体水平进而研究预测生物体的运行模式。而我们则采用“自上而下”（Top Down）的策略。通过对细菌采用各种不同的生理学扰动（如采用不同的营养以及逆境条件使得细菌的生长速率这个全局参数受到影响），研究细菌生理水平上的响应，包括各种大分子组分如核糖体、蛋白质、RNA、以及 DNA 的含量变化、定量测定各种基因表达水平的变化、定量测定各种代谢类以及调控类小分子的含量变化。通过这些全局信息，总结出定量模型，用于预测细菌这个系统的生理响应模式，有助于理解生物体基因表达调控的意义，理解细菌最根本的全局基因表达调控策略以及其分配蛋白质组以及代谢组资源的策略。

近期论文

Zhu M, Mori M, Hwa T, Dai X. (2019). Disruption of transcription-translation coordination in Escherichia coli leads to premature transcriptional termination. Nature Micorbiology. DOI: 10.1038/s41564-019-0543-1. (IF: 14.3).
Zhu M, Dai X. (2019). Maintenance of translational elongation rate underlies the survival of Escherichia coli during oxidative stress. Nucleic acids Research gkz467 47(14) 7592-7604, (2019). (IF: 11.1).
Zhu M, Pan, Y, Dai X. (p)ppGpp: the magic governor of bacterial growth economy. Curr Genet 2019,1-5. (invited review) (IF: 3.6).
Zhu M, Dai X. (2019). Growth suppression by altered (p)ppGpp level results from non-optimal resource allocation in Escherichia coli. Nucleic acids Research gkz211 47(9) Pages 4684–4693 (First Author) (IF: 11.1).
Dai X, Shen Z, Wang Y, Zhu M. (2018). Sinorhizobium meliloti, a slow-growing bacterium, exhibits growth rate dependence of cell size under nutrient limitation. mSphere 3:e00567-18. (IF: 4.5)
Dai X, Zhu M. (2018). High osmolarity modulates bacterial cell size through reducing initiation volume in Escherichia coli. mSphere 3:e00430-18. (IF:4.5)
Zhu M, Dai X. (2018). High salt cross-protects Escherichia coli from antibiotic treatment through increasing efflux pump expression. mSphere 3:e00095-18. (First Author) (IF:3.6).
Zhu M, Dai X. (2018) On the intrinsic constraint of bacterial growth rate: M. tuberculosis’s view of protein translation capacity. Critical Reviews in Microbiology. 44(4). (First Author) (IF: 5.7)
Dai X*, Zhu M*, Warren M, Balakrishnan R, Okano H, Williamson JR, Fredrick K, Hwa T. (2018). Slowdown of translational elongation in Escherichia coli under hyperosmotic stress. mBio 9:e02375-17. (Co-first Author) (IF: 6.75)
Zhu M, Dai X, Guo W, Ge Z, Yang M, Wang H, Wang Y-P. (2017). Manipulating the bacterial cell cycle and cell size by titrating the expression of ribonucleotide reductase. mBio 8:e01741-17. (Co-first Author) (IF: 6.75)
Dai, X*., Zhu, M*., Warren, M., Balakrishnan R., Okano, H., Fredrick, K., Wang, Y. P., & Hwa, T. (2016). Reduction of translating ribosomes enables Escherichia coli to maintain elongation rates during slow growth. Nature Microbiology, 2, 16231. (Co-first Author) (IF: 14.3)
Zhu, M., Dai, X., & Wang, Y. P. (2016). Real time determination of bacterial in vivo translation elongation speed based on LacZ alpha complementation assay. Nucleic acids research, 44(20): e155. (First Author) (IF: 11.1)
Basan, M*., Zhu, M*., Dai, X., Warren, M., Sévin, D., Wang, Y. P., & Hwa, T. (2015). Inflating bacterial cells by increased protein synthesis. Molecular Systems Biology, 11(10), 836. (Co-first Author) (IF: 9.8)
Dai, X*., Zhu, M*., & Wang, Y. P. (2014). Circular permutation of E. coli EPSP synthase: increased inhibitor resistance, improved catalytic activity, and an indicator for protein fragment complementation. Chemical Communications, 50(15), 1830-1832. (Co-first Author) (IF: 6.3)