个人简历

广东省畜禽遗传资源委员会-猪专业委员会委员，国家生猪产业技术体系杂交配套岗位骨干，曾赴泰国、香港、新加坡、法国、丹麦和瑞典等地区或国家进行访问学习和学术交流。
主持国家自然科学基金青年项目1项、中国博士后科学基金项目1项、广东省自然科学基金面上项目2项、广东省教育厅青年创新人才项目1项、广州市科技计划项目1项、华南农业大学青年科技创新人才项目1项等项目，共11项。参加广东省重点研发计划、国家自然科学基金面上项目、国家科技基础性工作专项等项目。
近年来，在Genetics、Frontiers in Cell and Developmental Biology、BMC Genomics、Journal of Animal Science and Biotechnology和Biological Procedures Online等国际学术期刊，发表SCI论文41篇，其中以第一作者或通讯作者发表SCI论文20篇；以第一作者或通讯作者在《中国实验动物学报》、《中国农业科学》、《畜牧兽医学报》等中文核心期刊发表论文6篇；以第一完成人获得国家软件著作权登记5项，获得授权的国家发明专利5项，其中第一完成人3项，另以第一完成人申报国家发明专利5项。
工作经历
2017.7-至今, 华南农业大学, 动物科学学院, 副教授
教育经历
(1) 2016.5–2017.5, 丹麦哥本哈根大学, 动物表观遗传学, 博士生联合培养;
(2) 2011.9–2017.9, 华南农业大学, 动物遗传育种与繁殖, 硕博连读;
(3) 2007.9–2011.6, 华南农业大学, 动物科学, 学士.
获奖、荣誉称号
2019年12月获吴常信动物遗传育种科技成果奖（第4完成人）；
2016年04月获丹麦哥本哈根大学“嘉士伯基金”奖励；
2015年11月获吴常信动物遗传育种专项基金奖励。
科研项目
（1）国家自然科学基金青年项目，MMP2基因启动子低甲基化延缓母猪初情启动的机制研究，24万，主持
（2）广东省自然科学基金面上项目，STAT4基因启动子低甲基化抑制母猪卵泡成熟的机制研究，10万，主持
（3）广州市科技计划项目，STAT4基因启动子低甲基化延缓母猪初情启动的机制研究，20万，主持
（4）广东省教育厅青年创新人才项目，STAT4调控KISS1的转录影响母猪卵泡成熟的机制，8万，主持
（5）华南农业大学青年科技人才项目，LncRNAs介导雄激素调控母猪有腔卵泡闭锁的分子机制研究，20万，主持
（6）农业部产业体系，国家生猪现代产业技术体系岗位科学家，350万元，参加
（7）广东省重点研发计划项目，地方猪育种技术体系研发与新品系创建，子课题，65万，参加
（8）国家自然科学基金面上项目，基于序列并整合生物学先验的全基因组预测新方法研究，61万，参加
（9）广州市科技计划项目，基于组学信息的畜禽基因组遗传评定方法研究，30万，参加
（10）广东省自然科学基金项目，基于畜禽基因组序列数据的基因组 选择遗传评定方法研究，10万，参加
（11）国家自然科学基金青年基金项目，母猪卵巢早衰相关miR-148a功能鉴定 与分子调控机制研究，23万元，参加
科研创新
1、发明专利 袁晓龙、李加琪、李忠慧、张哲、孔亚茹 p65基因在猪卵巢颗粒细胞中调控FGFR1基因的应用 201910524967.2 2019/6/18 2020/10/9 第4025234号
2、发明专利 袁晓龙、何颖婷、张豪、张哲、钟玉宜 组蛋白甲基化H3K4me3在猪卵巢颗粒细胞中的应用 201811588889.4 2018/12/25 2020/12/8 第4256821号
3、发明专利 袁晓龙、辛晓萍、张豪、钟玉宜 母猪 MMP2 基因在促进卵巢颗粒细胞中 E2 生成的应用 201810203363.3 2018/3/13 2020/4/17 第3757868号
4、发明专利 张哲、袁晓龙、李加琪、周小枫 STAT3在猪卵巢颗粒细胞中的应用 201810039848.3 2018/1/16 2020/7/31 第3915970号
5、发明专利 李加琪、李忠慧、袁晓龙、张哲、钟玉宜 FGFR1基因在猪卵巢颗粒细胞中的应用 201811588890.7 2018/12/25 2020/7/3 第3873785号
6、发明专利 李加琪、张哲、袁晓龙、辛晓萍 Kiss1基因在促进卵巢颗粒细胞中E2生成的应用 201711395885.X 2017/12/21 2020/4/17 第3759300号
7、软件著作权 袁晓龙、龚文滔、张哲、潘向春、吉冠玉 评估全基因组单碱基DNA甲基化数据比对软件性能的软件 2021SR0025702
8、软件著作权 袁晓龙、李加琪、张哲、潘向春、张豪 基于单碱基分辨率的DNA甲基化组学数据计算DNA甲基化差异位点和基因的软件 2019SR0616945
9、软件著作权 袁晓龙、陈子韬、潘向春、黄树文 计算基因组CpG位点密度分布和图示化的软件 2019SR0279287
10、软件著作权 袁晓龙、李加琪、张哲、张豪 基于单碱基分辨率DNA甲基化组学数据的计算基因组特定区域甲基化模式软件 2017SR605537
11、软件著作权 袁晓龙、张豪、李加琪、张哲 基于基因座位信息对CpG岛元件进行注释的软件 2017SR614532
12、软件著作权 李加琪、袁晓龙、张豪、张哲、潘向春 计算DNA甲基化差异基因元件及图示化软件 2019SR0616958
教学活动
《动物育种学》、《生物统计附试验设计》、《生物信息学》、《动物遗传原理与育种方法》
我的团队
李加琪 教授
张 哲教授
张 豪 教授
陈赞谋 副教授

研究领域

家畜功能基因组学和生物信息学。"家畜功能基因组学和生物信息学"

近期论文

1. Yingting He, Xiaofeng Zhou, Yaru Kong, Liying Li, Rongrong Zheng, Yao Jiang, Ailing Zhang, Zhe Zhang, Jiaqi Li and Xiaolong Yuan*, “Association of a SNP in the EXOC4 gene and reproductive traits suggests it as a breeding marker in pigs”, Animals, 2021, 11, 521.
2. Li Q, Pan X, Li N, Gong W, Chen Y and Yuan XL*. Identification of Circular RNAs in Hypothalamus of Gilts during the Onset of Puberty. Genes (Basel). 2021;12.
3. Zhou X, He Y, Jiang Y, He B, Deng X, Zhang Z, Yuan XL* and Li JQ*. MiR-126-3p inhibits apoptosis and promotes proliferation by targeting phosphatidylinositol 3-kinase regulatory subunit 2 in porcine ovarian granulosa cells. Asian-Australas J Anim Sci. 2020;33:879-887.
4. Zhong Y, Li L, He Y, He B, Li Z, Zhang Z, Zhang H, Yuan XL* and Li JQ*. Activation of Steroidogenesis, Anti-Apoptotic Activity, and Proliferation in Porcine Granulosa Cells by RUNX1 Is Negatively Regulated by H3K27me3 Transcriptional Repression. Genes (Basel). 2020;11.
5. Zhong Y, Li L, Chen Z, Diao S, He Y, Zhang Z, Zhang H, Yuan XL* and Li JQ*. MIR143 Inhibits Steroidogenesis and Induces Apoptosis Repressed by H3K27me3 in Granulosa Cells. Front Cell Dev Biol. 2020;8:565261.
6. Yuan XL, Zhou X, Qiao X, Wu Q, Yao Z, Jiang Y, Zhang H, Zhang Z, Wang X and Li J. FoxA2 and p53 regulate the transcription of HSD17B1 in ovarian granulosa cells of pigs. Reprod Domest Anim. 2020.
7. Yuan XL, Pan J, Wen L, Gong B, Li J, Gao H, Tan W, Liang S, Zhang H and Wang X. MiR-590-3p regulates proliferation, migration and collagen synthesis of cardiac fibroblast by targeting ZEB1. J Cell Mol Med. 2020;24:227-237.
8. Jiang Y, Xin X, Pan X, Zhang A, Zhang Z, Li J and Yuan XL*. STAT4 targets KISS1 to promote the apoptosis of ovarian granulosa cells. J Ovarian Res. 2020;13:135.
9. Chen ZT, Pan XC, Kong YR, Jiang Y, Zhong YY, Zhang H, Zhang Z, Yuan XL* and Li JQ*. Pituitary-Derived Circular RNAs Expression and Regulatory Network Prediction During the Onset of Puberty in Landrace x Yorkshire Crossbred Pigs. Front Genet. 2020;11.
10. Yuan XL, Li ZH, Kong YR, Zhong YY, He YT, Zhang AL, Zhou XF, Jiang Y, Zhang Z, Zhang H and Li JQ. P65 Targets FGFR1 to Regulate the Survival of Ovarian Granulosa Cells. Cells. 2019;8.
11. Yuan XL, Zhou X, Chen Z, He Y, Kong Y, Ye S, Gao N, Zhang Z, Zhang H and Li J. Genome-Wide DNA Methylation Analysis of Hypothalamus During the Onset of Puberty in Gilts. Front Genet. 2019;10:228.
12. Yuan XL, Ye S, Chen Z, Pan X, Huang S, Li Z, Zhong Y, Gao N, Zhang H, Li J and Zhang Z. Dynamic DNA methylation of ovaries during pubertal transition in gilts. BMC Genomics. 2019;20:510.
13. Yuan XL, Pan J, Wen L, Gong B, Li J, Gao H, Tan W, Liang S, Zhang H and Wang X. MiR-144-3p Enhances Cardiac Fibrosis After Myocardial Infarction by Targeting PTEN. Front Cell Dev Biol. 2019;7:249.
14. Yuan XL, Li Z, Ye S, Chen Z, Huang S, Zhong Y, Zhang H, Li J and Zhang Z. Genome-wide DNA methylation analysis of pituitaries during the initiation of puberty in gilts. PLoS One. 2019;14:e0212630.
15. Yuan XL, Zhou XF, He YT, Zhong YY, Zhang AL, Zhang Z, Zhang H and Li JQ. C/EBP beta Promotes STAT3 Expression and Affects Cell Apoptosis and Proliferation in Porcine Ovarian Granulosa Cells. Genes-Basel. 2018;9.
16. Yuan XL, Deng X, Zhou XF, Zhang AL, Xing Y, Zhang Z, Zhang H and Li JQ. MiR-126-3p promotes the cell proliferation and inhibits the cell apoptosis by targeting TSC1 in the porcine granulosa cells. In Vitro Cell Dev-An. 2018;54:715-724.
17. Ye S#, Yuan XL#, Lin X, Gao N, Luo Y, Chen Z, Li J, Zhang X and Zhang Z. Imputation from SNP chip to sequence: a case study in a Chinese indigenous chicken population. J Anim Sci Biotechnol. 2018;9:30.
18. Yuan XL, Zhang Z, Pan RY, Gao N, Deng X, Li B, Zhang H, Sangild PT and Li JQ. Performances of Different Fragment Sizes for Reduced Representation Bisulfite Sequencing in Pigs. Biol Proced Online. 2017;19:5.
19. Yuan XL, Zhang Z, Li B, Gao N, Zhang H, Sangild PT and Li JQ. Genome-wide DNA methylation analysis of the porcine hypothalamus-pituitary-ovary axis. Sci Rep. 2017;7.
20. Yuan XL, Gao N, Xing Y, Zhang HB, Zhang AL, Liu J, He JL, Xu Y, Lin WM, Chen ZM, Zhang H, Zhang Z and Li JQ. Profiling the genome-wide DNA methylation pattern of porcine ovaries using reduced representation bisulfite sequencing. Sci Rep. 2016;6.
广东省畜禽遗传资源委员会-猪专业委员会委员