个人简历

作为学科带头人，创建了哈医大药物分析和药物基因组信息学两个学科，完成了《国内示范性药物生物信息学教学体系建立》。几年来承担国家和省部级科研课题13项，先后发表有代表性的科研论文30多篇，其中SCI收录论文20篇。获国家级优秀论文奖1项，省部级科研奖励2项，国家发明专利1项和软件著作权1项。主编（审）及参编卫生部国家级规划教材4部。国家高教委“十一五”规划教材1部，以及以副主编身份参加的人民卫生出版社出版的专著1部。多年来带领课题组进行了药物基因组信息学多个方向的研究：主要以大数据为中心，建立相关的流程和平台为新药发现提供前期的有效性和成药性评估，以增加新药研发的成功率。如复杂疾病多靶点药物研发；基于大数据的药物毒性机制研究；基于个体基因组差异的药物风险人群预测及毒性表征研究；基于系统药理学和网络药理学进行的中药药效群研究，为临床个性化给药和合理药物设计提供了新思路。

在研与完成科研项目
在研课题：
基于药物-亚结构-作用表型关联网络的药物重定位和不良反应预测
国家自然科学基金面上项目（61671191）
第1主持人（2017.1-2020.12）
Drug-ADR-Pathway复合网络构建及ADR分子机制研究
国家自然科学基金面上项目（61372188）
第1主持人（2014.1-2017.12）
3.基于复合网络的药物不良反应机制研究与预测2.5
黑龙江省教育厅面上项目（11531112）
第1主持人（2014.1-2017.12）
4.红松松塔提取物抗肿瘤药物研制
黑龙江省教育厅前期培育项目
第1主持人（2014.1-2017.12）8
已结课题：
药源性长QT综合症：hERG抑制剂诱导的转录后调控网络
国家自然科学基金青年项目（31301094）
第2主持人（2014.1-2017.12）
2.基于RBF神经网络方法的药物生物利用度预测
黑龙江省高教厅课题(11541121)2
第1主持人(2010.1-2012.12)
3.应用基因表达标识系统筛查红松松塔的典型药理活性
哈尔滨市科技局优秀学科带头人课题（2009AA3CN166）5
第1主持人(2010.1_2012.12)
4.木犀草素及其前体药物的药物动力学研究
黑龙江省科技厅攻关课题（GC07C337）5
第1主持人（2008.1-2010.12）
5.脲酶抑制剂乙酰氧肟酸的中试研究
哈尔滨市科技局攻关课题（2004AA3CN155）8
第1主持人（2004.1-2007.12）
6.RAPD法在黑龙江省道地药材防风中的鉴定应用
黑龙江省科技厅攻关课题（GC03C401-4）3
第1主持人（2003.1-2006.12）
7.艾迪注射液指纹图谱研究
科技部重大攻关项目
第3主持人（2003.3-2005.3）
8.碘锌联合缺乏对克汀病发生发展的影响
国家自然科学基金面上项目
第2主持人（1995.1-1998.12）
9.食用合格碘盐的孕妇碘营养状况调查
黑龙江省卫生厅面上项目
第1主持人（1998.1-2000.12）
科研奖励情况：
1.陈秀杰，刘磊，孙志忠。木犀草素与四乙酰化木犀草素的药物动力学比较研究，第十二届黑龙江省自然科学技术学术成果一等奖，2011。
2.陈秀杰，徐建凯。基于子通路和主效网络的药物作用机制研究，哈尔滨市2011年度自然科学技术学术成果二等奖，2011。
3.陈秀杰。1999年全国碘缺乏病健康教育效果评估,2000年获中华医学会碘缺乏病分会优秀论文奖，2000
4.王丹娜，陈秀杰，刘守军，石玉霞，于君，吕建国。国家自然基金项目《碘锌联合缺乏在地方性克汀病病因及发病中的作用》,黑龙江省政府科技进步三等奖，2000。
5.发明专利：杨宝峰陈秀杰朱文良李霞,一种红松松塔提取物的制备方法，2010，中国，200710144691.2
6.软件著作权：陈秀杰、徐建凯、刘磊、李霞、杨瑞智，药物反应通路分析平台V1.0，2013.2，中国，2013SR013446，软著登字第0519208号
7.承担的黑龙江省高教厅课题«国内示范性药物基因组信息学课程体系建设»获得了2012年度黑龙江省优秀高等教育科学研究成果二等奖。
8.以副主编身份编写的由人民卫生出版社出版的统编教材«药物分析学»获山东省高等教育科学研究成果二等奖。
主编的著作
1.2013年以副主编身份编写了人民卫生出版社出版的«生物信息学理论与医学实践»专著。
2.参编高教出版社出版的十一.五高等教育国家规划教材«药物分析学»。
3.以副主编身份编写了人卫出版社出本的国家规划教材«药物分析学»。
4.主编了科学文献出版社出版的«药物分析学»。
5.面向全校的讲座：后基因组时代药物研发新模式。
多年来带领课题组进行了药物基因组信息学多个方向的研究：主要以大数据为中心，建立相关的流程和平台为新药发现提供前期的有效性和成药性评估，以增加新药研发的成功率。如复杂疾病多靶点药物研发；基于大数据的药物毒性机制研究；基于个体基因组差异的药物风险人群预测及毒性表征研究；基于系统药理学和网络药理学进行的中药药效群研究，为临床个性化给药和合理药物设计提供了新思路。

近期论文

ChenX#,LiuL#,WangY#,LiuB,ZengD,JinQ,LiM,ZhangD,LiuQ,XieH.Identificationofbreastcancerrecurrenceriskfactorsbasedonfunctionalpathwaysintumorandnormaltissues.Oncotarget.2016;doi:10.18632/oncotarget.11557.(SCI,IF=5.168)
LingxiangWu,#XiujieChen,#*DenanZhang,#WubingZhang,#LeiLiu,HongzheMa,JingboYang,HongboXie,BoLiu,andQingJin.IGSA:IndividualGeneSetsAnalysis,includingEnrichmentandClustering.PlosOne,2016,11(10):e0164542.(SCI,IF=3..234)
HongboXie,aHaixiaWen,bMingzeQin,cJieXia,aDenanZhang,aLeiLiu,aBoLiu,aQiuqiLiu,aQingJinaandXiujieChen*aInsilicodrugrepositioningforthetreatmentofAlzheimer’sdiseaseusingmoleculardockingandgeneexpressiondata.RSCAdvances,2016,10(6):98080-98090.(SCI,IF=3.289)
WangY#,ChenX#*,LiuL#,ChenY,MaH,YangR,LiuX.Identifyingthecausativeproteinsofsimilarsideeffectpairstoexplorethecommonmolecularbasisofthesesideeffects.MolecularBiosystems.2015;11:2060-2067.(SCIIF=3.21)
FuJianTan1,XiujieChen1*,RuiZhiYang1,XiaoxueXu1,XiaoDongJia,XiangQiongLiu,YueLongChen,HongzheMa,LeiLiu，Drugrepositioningbyapplying‘expressionprofile’generatedthroughintegratingchemicalstructuresimilarityandgenesemanticsimilarity.MolecularBioSystems2014,10,1126-1138(SCI,IF=3.35)
XiujieChen1,*FuJianTan1，XiaoDongJia1,XiangQiongLiu1,ShengChen,JiankaiXu,LeiLiu,RuiZhiYang,YunFengWang,YueLongChen，TheNetworkCharacteristicAnalysisofADR-relatedProteinandIdentificationofADR-ADRAssociation.ScientificReports。2013,doi:10.1038/srep01744(SCI，IF=2.927)
JIAXiao-Dong,XUJian-Kai,CHENXiu-Jie**,TANFu-Jian,LIUXiang-Qiong,LIULei,YANGRui-Zhi，AMethodofPathwayEnrichmentAnalysisBasedGeneExpressionVariability.ProgressinBiochemistryandBiophysics,2013.(,SCIIF=0.554)
XiujieChen*,RuizhiYang,JiankaiXu,HongzheMa,ShengChen，XiusenBian,LeiLiu.AsensitivemeasureforcomputingGO-basedfunctionalsimilaritiesamonggeneswith‘shallowannotation’.Gene,Volume509,Issue1,2012.(SCIIF=2.341)
XiujieChen*,JiankaiXu,BangqingHuang,JinLi,XinWu,LingMa,XiaodongJia,XiusenBian,FujianTan,LeiLiu,ShengChen,XiaLi*,Asub-pathway-basedapproachforidentifyingdrugresponseprincipalnetwork.Bioinformatics，Volume27,Issue5,pages.649-654(6),2011.(SCIIF=5.468)
XiujieChen,LeiLiu,ZhizhongSun,YongshengLiu,JiankaiXuandKaishunBi*.Pharmacokineticsofluteolinandtetra-acetyl-luteolinassayedbyHPLCinratsafteroraladministration.BiomedicalChromatography,Volume24,Issue8,pages826-832,2010.(SCIIF=3.06)
MingzhuZhu,LeiGao,XiaLia,ZhichengLiu,ChunXu,YuqingYan,XuijieChen,HuiLin.Theanalysisofthedrug-targetsbasedonthetopologicalpropertiesinthehumanprotein-proteininteractionnetwork.JournalofDrugTargeting,Volume17,Issue7,pages524-532,2009.(SCIIF=2.885)
WeiJiang,XiaowenChen,MingzhiLiao,WeiLi,BaofengLian,LihongWang,FanlinMeng,XinyiLiu,XiujieChen,YanJin4,XiaLi*.IdentificationoflinksbetweensmallmoleculesandmiRNAsinhumancancersbasedontranscriptionalresponses.ScientificReportsVolume:2,Articlenumber:282,2012.(SCIIF=5.486)
中华中医药学会中药分析专业委员会委员，中国医药生物技术协会生物医学信息技术分会第二届委员会常务委员，国家基金委，教育部博士点基金，北京市，天津市，浙江，辽宁，陕西等省份的基金项目和科技奖励信函评审专家。