个人简历

教育经历:
2001.9-2005.7，中国科学院动物研究所（北京）,农业虫鼠害综合治理国家重点实验室所属的分子生态和进化研究组，攻读生态学专业博士学位。研究方向：种群遗传学和系统发生生物地理学.
1998.9-2001.6，华东师范大学生物系, 动物生态学研究组，攻读生态学硕士学位，研究方向：保护生物学、行为学和种群生态学。
1994.9-1998.6，华东师范大学生物系，获得生物学专业学士学位。
工作经历:
2011.10-至今，华东师范大学，河口海岸学国家重点实验室，助理研究员、副研究员。
2005.8-2011.10，农业部中国水产科学研究院东海水产研究所，助理研究员，从事海洋动物遗传多样性、谱系生物地理演化历史研究。
海外工作和访学经历:
2013.11-2014.11，伍兹霍尔海洋研究所(Woods Hole Oceanographic Institution, MA, USA)，地球化学系，访问学者。
个人简介:
研究兴趣在于采用DNA分子标记方法，探讨淡水和海洋环境的生物进化历史，及其与古气候、古地质和古海洋环境的协同演化关系。
主要包含如下三个方向研究内容：
一．谱系生物地理学：这是一门基于地学和生物学之间的桥梁学科。本方向主要是采用分子标记方法‚研究生物的不同遗传谱系在地球上的空间分布规律‚及其形成的历史原因。在生物进化史上‚会经历各种古地质、气候和海洋物理化学环境的波动事件‚这些事件都可通过改变生物空间分布区域和种群数量‚从而在生物种群水平留下遗传烙印。我们通过采用比较系统发生生物地理学方法‚对比不同生态习性和不同生活史特征的物种所呈现的共性的谱系地理演化格局‚可以揭示一定空间范围内生物经历的一些共性历史事件（比如气候变化引起的海面升降、海流变化和河流演化等）‚这将有助于为地球演化历史研究提供有力的生物学证据。
二．种群遗传学：采用分子标记方法‚研究种群水平的遗传结构及不同地理群体之间的基因交流状况。该方向目前关注焦点在于‚通过分析现代生物种群水平的基因信息‚可以基于溯祖理论来推断目前种群和祖先种群有效数量变化动态、群体间基因流大小和方向、群体分化时间等信息。这对于我们监测种群的数量演化过程、种群迁移历史等将是有益的手段。
三. 古生态学和古遗传学: 基于环境DNA信息,分析沉积物不同地层物种成分、丰度变化信息，以此重建古气候、古海洋环境变化背景下的生态群落。
欢迎有志于探索地球科学和生命科学交叉学科科学奥秘的优秀本科生，报考本课题组研究生。
通过3-5年研究生阶段训练，你将有机会体验陆地和海洋的生命奇观、自然演化历史、开阔科学视野、培养严密逻辑思维能力。
涉及的学科领域包括：生命科学（生态学、生物化学、植物学、动物学）、地球科学（地质、地理、大气、海洋、古生物）、环境科学、化学、数学和物理学等。
科研项目:
主持项目:
1. 2018.12-2022.12, 科技部，国家重点研发计划“蓝色粮仓科技创新”重点专项(2018YFD0900900)，“我国重要渔业水域食物网结构特征与生物资源补充机制”，子任务。
2. 2018.09-2021.08, 上海市科学技术委员会，“2018年度上海科委科技创新行动计划”“一带一路”国际合作项目(18230743200)，“孟加拉和中国南海沿岸招潮蟹谱系生物地理格局比较研究”。
3. 2016.07-2021.6, 科技部，国家重点研发计划的“全球变化及应对”重点专项(2016YFA0600900)，“大型水库对河流-河口系统生物地球化学过程和物质输运的影响机制”，子任务。
4. 2016.1-2017.12, 中国科学院热带海洋生物资源与生态重点实验室, 开放基金(LMB151001), \

研究领域

海洋分子生态学专业,主要集中于如下领域:

一．谱系生物地理学：这是一门基于地学和生物学之间的桥梁学科。本方向主要是采用分子标记方法‚研究生物的不同遗传谱系在地球上的空间分布规律‚及其形成的历史原因。在生物进化史上‚会经历各种古地质、气候和海洋物理环境的波动事件‚这些事件都可以通过改变生物空间分布区域和种群数量‚从而在生物种群水平留下遗传烙印。我们通过采用比较系统发生生物地理学方法‚对比不同生态习性和不同生活史特征的物种所呈现的共性的谱系地理演化格局‚可以揭示一定空间范围内生物经历的一些共性历史事件（比如气候变化引起的海面升降、海流变化等）‚这将有助于为地球演化历史研究提供有力的生物学证据。
二．种群遗传学：采用分子标记方法‚研究种群水平的遗传结构及不同地理群体之间的基因交流状况。该方向目前关注焦点在于‚通过分析现代生物种群水平的基因信息‚可以基于溯祖理论来推断目前种群和祖先种群有效数量变化动态、群体间基因流大小和方向、群体分化时间等信息。这对于我们监测种群的数量演化动态、种群迁移历史等将是有益的手段。
三. 古生态学和古遗传学: 基于古DNA信息,分析沉积物不同地层物种成分、丰度变化信息，以此重建古气候、古海洋环境变化背景下的生态群落。""

近期论文

2017
Orsi William D., Coolen Marco J. L., Wuchter Cornelia, He Lijun, More Kuldeep D., Irigoien Xabier, Chust Guillem, Johnson Carl, Hemingway Jordon D., Lee Mitchell, Galy Valier, Giosan Liviu (2017) Climate oscillations reflected within the microbiome of Arabian Sea sediments. Scientific Reports, 7, 6040; doi:10.1038/s41598-017-05590-9.
2015
He Lijun*, Mukai Takahiko, Chu Ka Hou, Ma Qiang, Zhang Jing (2015) Biogeographical role of the Kuroshio Current in the amphibious mudskipper Periophthalmus modestus indicated by mitochondrial DNA data. Scientific Reports, 5, 15645; doi: 10.1038/srep15645.
2014
HE Lijun*, Zhang Aibing, Weese David, Li Shenfa, Li Jiansheng, Zhang Jing (2014) Demographic response of cutlassfish (Trichiurus japonicus and T. nanhaiensis) to fluctuating palaeo-climate and regional oceanographic conditions in the China seas. Scientific Reports, 4, 6380; DOI:10.1038/srep06380.
2013
Tang Fenghua, Wang Jinglong, Liu Dantong, He Lijun, Du Jinzhou* (2013) Distribution of Fukushima Accident-derived Radionuclides in Neon flying squid in the North Pacific Ocean. Journal of Agro-environment Science, 32(10), 2066-2071. (in Chinese)
2012
Jin Qian, He Lijun, Zhang Aibing* (2012) A simple 2D non-parametric resampling statistical approach to assess confidence in species identification in DNA Barcoding—An alternative to likelihood and Bayesian approaches. PLoS ONE, 7(12), e50831. doi:10.1371/journal.pone.0050831
Yang Fan, HE Lijun, Lei Guangchun* , Zhang Aibing (2012) Genetic diversity and DNA barcoding of mudskipper common species along southeast coasts of China. Chinese Journal of Ecology, 31(3), 676-683. (in Chinese)
2011
He Lijun*, Zhang Aibing, Zhu Chaodong, Weese David and Qiao Zhenguo. (2011) Phylogeography of the mud crab (Scylla serrata) in the Indo-West Pacific reappraised from mitochondrial molecular and oceanographic clues: Transoceanic dispersal and coastal sequential colonization. Marine Ecology, 32(1), 52-64.
2010
Zhang Aibing*, He Lijun, Crozier R.H., Muster C. and Zhu Chaodong (2010) Estimating sample sizes for DNA barcoding. Molecular Phylogenetics and Evolution, 54(3),1035-1039.
He Lijun*, Zhang Aibing, Weese David, Zhu Chaodong, Jiang Chaojun, Qiao Zhenguo (2010) Late Pleistocene expansion of Scylla paramamosain along the Chinese coast: a population dynamics response to the Last Interglacial sea level highstand. Journal of Experimental Marine Biology and Ecology,385, 20-28.
He Lijun*, Zhang Aibing, Zhu Chaodong, Liu Jianyi (2010) Genetic imprints of Paleo-oceanographic conditions in the Chinese seas: Population bottlenecks of Scylla paramamosain and Periophthalmus modestus inferred from mitochondrial genes. Journal of Earth Science, 21,special issue, 237-240.
中国环境科学学会海洋生态安全专业委员会委员，Reviewer for the following journals: Scientific Reports, Journal of Biogeography, Molecualr Biology Reports,Journal of Crustacean Biology,Continental Shelf Research, Marine and Freshwater Research, Zoological Study,Journal of the Marine Biological Association,African Journal of Agricultural Research, African Journal of Biotechnology, Journal of Integrative Agriculture, Open Journal of Marine Science, Pakistan Journal of Zoology,Biodiversity Science,SCIENCE CHINA Life Sciences