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黄永棋
2023-05-10 16:54
  • 黄永棋
  • 黄永棋 - 副教授 博士-湖北工业大学-生物工程与食品学院-个人资料

近期热点

资料介绍

个人简历


2016.10-至今:湖北工业大学生物工程与食品学院生物工程专业副教授
2016.01-2016.09:山东大学化学与化工学院物理化学专业助理研究员
2012.09-2015.09:美国St.JudeChildren’sResearchHospital结构生物学专业博士后
2007.09-2012.07:北京大学化学与分子工程学院物理化学专业获博士学位
2002.09-2007.07:山东大学化学与化工学院应用化学专业获学士学位

1)国家自然科学基金青年项目:天然无序蛋白质“序列—结构—功能”关系的比较研究,2017.1-2019.12。
2)北京分子科学国家实验室开放基金:蛋白质折叠与结合耦合机理的研究,2017.03-2019.03。
3)武汉艾默佳华生物科技有限公司:2型糖尿病药物靶点GLP-1受体小分子拮抗剂设计与活性分析,2017.03-2018.03。
4)湖北省重大技术创新专项:基于植物甾醇半生物法合成抗癌药物醋酸阿比特龙关键技术研发,2016.10-2018.12。
5)中国科学院武汉物理与数学研究所波谱与原子分子物理国家重点实验室开放基金:癌蛋白Mdm2抑制剂对MdmX的构效关系及新型双靶向抗肿瘤药物筛选,2016.9-2018.9。


从事药物设计和蛋白质—药物相互作用的研究工作,具有多年从事蛋白质相互作用表征和药物设计及筛选的经验。建立了基于MdmX/p53融合蛋白以及色氨酸内源荧光的筛选技术,成功筛选出了多个与MdmX具有一定结合能力的新型小分子化合物;建立了蛋白质与靶标结合的动力学与热力学参数数据库;探索了蛋白质结构柔性对蛋白质分子识别机理的影响;通过序列设计探索了细胞周期抑制因子p21蛋白和p27蛋白的结构、功能以及动态学性质,探索了p21蛋白与Cdk2/cyclinA复合物的多种结合模式以及p27蛋白降解过程的调控机理。

研究工作从多个角度上探索了蛋白质在分子识别中的特性以及功能,促进了对蛋白质“序列—结构—功能”关系以及药物定量构效关系的进一步认识,相关研究成果得到了国际同行的诸多正面引用和好评。本领域权威专家VladimirUversky在Facultyof1000Biology上对研究成果作了专文推介(http://f1000.com/prime/1226965),评价为“Thisisaveryinteresting,important,andprovocativestudywhichwillbeofinteresttoeveryonestudyingproteininteractions.”。在2014年美国化学会出版的ChemicalReview(第114卷,第13期,一共发表了12篇综述文章)中,3项研究工作在其中3篇综述文章中得到了引用。2009年至今,共发表SCI学术论文20多篇,总被引用500多次:















最新的论文引用统计参加google学术网页:

(https://scholar.google.com/citations?user=jQbClzQAAAAJ&hl=en)

论文列表
2018
1.Exploringthesequence-structure-functionrelationshipfortheintrinsicallydisorderedβγ-crystallinHahellin.MGao,FYang,LZhang,ZSu*,YHuang*.JournalofBiomolecularStructureandDynamics201836(5),1171-1181
2.ExploringtheRolesofProlineinThree-DimensionalDomainSwappingfromStructureAnalysisandMolecularDynamicsSimulations.YHuang*,MGao,ZSu*.Theproteinjournal201837(1),13-20

2017
3.Bacterialcupredoxinazurinhijackscellularsignalingnetworks:Protein–proteininteractionsandcancertherapy.MGao,JZhou,ZSu*,YHuang*.ProteinScience201726(12),2334-2341
4.Anovelstrategytopreparetheprecursorpeptideofliraglutide.NCheng,LYang,NDai,ZHu,FYang,RChen,XCheng,JZhou,YHuang*,ZSu*.ProcessBiochemistry201762,10-15
5.DecipheringthepromiscuousinteractionsbetweenintrinsicallydisorderedtransactivationdomainsandtheKIXdomain.YHuang*,MGao,FYang,LZhang,ZSu*.Proteins:Structure,Function,andBioinformatics201785(11),2088-2095
6.EffectoftheFlexibleRegionsoftheOncoproteinMouseDoubleMinuteXonInhibitorBindingAffinity.LQin,HLiu,RChen,JZhou,XCheng,YChen,YHuang*,ZSu*.Biochemistry201756(44),5943-5954
7.Afusionproteinofthep53transactiondomainandthep53-bindingdomainoftheoncoproteinMdmXasanefficientsystemforhigh-throughputscreeningofMdmXinhibitors.RChen,JZhou,LQin,YChen,YHuang*,HLiu*,ZSu*.Biochemistry201756(25),3273-3282
8.ComprehensiveinvestigationofaberrantmicroRNAsexpressionincellsculturemodelofMnCl2-inducedneurodegenerativedisease.RHe,XXie,LLv,YHuang,XXia,XChen,LZhang.Biochemicalandbiophysicalresearchcommunications2017486(2),342-348

2016
9.Model-GuidedInterfaceProbeArrangementforSensitiveProteinDetection.XXu,LWang,YHuang,WGao,KLi,WJiang.AnalyticalChemistry201688(20),9885-9889
10.Interplaybetweenbindingaffinityandkineticsinprotein–proteininteractions.HCao,YHuang*,ZLiu*.Proteins:Structure,Function,andBioinformatics201684(7),920-933
11.Crypticsequencefeatureswithinthedisorderedproteinp27Kip1regulatecellcyclesignalingRKDas#,YHuang#,AHPhillips#,RWKriwacki*,RVPappu*.ProceedingsoftheNationalAcademyofSciences2016113(20),5616-5621

2015
12.TheActivityandStabilityoftheIntrinsicallyDisorderedCip/KipProteinFamilyAreRegulatedbyNon-ReceptorTyrosineKinases.YHuang#,MKYoon#,SOtieno,MLelli,RWKriwacki*.Journalofmolecularbiology2015427(2),371-386

2014
13.Advantagesofproteinsbeingdisordered.ZLiu*,YHuang.ProteinScience201423(5),539-550

2013
14.Dointrinsicallydisorderedproteinspossesshighspecificityinprotein–proteininteractions?YHuang,ZLiu*.Chemistry–AEuropeanJournal201319(14),4462-4467
15.Evidencesfortheunfoldingmechanismofthree-dimensionaldomainswapping.ZLiu*,YHuang.ProteinScience201322(3),280-286

2012
16.Mechanismof3DDomainSwappingforMpro-C:CluesfromMolecularSimulations.YHuang,XKang,BXia,ZLiu*.ActaPhysico-ChimicaSinica201228(10),2411-2417
17.Bindingoftwointrinsicallydisorderedpeptidestoamulti-specificprotein:acombinedMonteCarloandmoleculardynamicsstudy.IStaneva,YHuang,ZLiu,SWallin*.PLoScomputationalbiology20128(9),e1002682
18.Three-dimensionaldomainswappingintheproteinstructurespace.YHuang,HCao,ZLiu*.Proteins:Structure,Function,andBioinformatics201280(6),1610-1619

2011
19.Anchoringintrinsicallydisorderedproteinstomultipletargets:lessonsfromN-terminusofthep53protein.YHuang,ZLiu*.Internationaljournalofmolecularsciences201112(2),1410-1430

2010
20.Smoothingmolecularinteractions:The“kineticbuffer”effectofintrinsicallydisorderedproteins.YHuang,ZLiu*.Proteins:Structure,Function,andBioinformatics201078(16),3251-3259
21.Nonnativeinteractionsincoupledfoldingandbindingprocessesofintrinsicallydisorderedproteins.YHuang,ZLiu*.PLoSOne20105(11),e15375
22.Intrinsicallydisorderedproteins:thenewsequence-structure-functionrelations.YHuang,ZLiu*.ActaPhysico-ChimicaSinica201026(8),2061-2072
23.Foldingsimulationsofadenovodesignedproteinwithaβαβfold.YQi#,YHuang#,HLiang,ZLiu*,LLai*.Biophysicaljournal201098(2),321-329

2009
24.Kineticadvantageofintrinsicallydisorderedproteinsincoupledfolding-bindingprocess:acriticalassessmentofthe“fly-casting”mechanism.YHuang,ZLiu*.Journalofmolecularbiology2009393(5),1143-1159
25.MoleculardynamicssimulationexplorationofcooperativemigrationmechanismofcalciumionsinsarcoplasmicreticulumCa2+-ATPase.YHuang,HLi,YBu*.Journalofcomputationalchemistry200930(13),2136-2145

研究领域


蛋白质-蛋白质相互作用、药物设计与高通量虚拟筛选、天然无序蛋白质

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